신종 코로나 바이러스 (COVID-19)




요즈음 전 세계적으로 가장 이슈가 되고 있는 것은 '신종 코로나 바이러스'라고 할 수 있겠습니다. 우리는 '코로나 바이러스' 보다는 사스(SARS) 또는 메르스(MERS)가 좀 더 익숙할 텐데요, 이전에 유행했던 사스와 메르스도 코로나 바이러스로 인해 발생한 질환입니다.

코로나 바이러스는 종이 다양하며, 인간에게는 가벼운 증상만을 일으키고 병원성이 약한 것으로 알려졌는데요. 이번에 발생한, 흔히 말하는 우한 폐렴은 코로나 바이러스가 변이를 일으킨 신종 코로나 바이러스로 인간에게 매우 심각한 영향을 미치고 있습니다.

우한 폐렴은 무엇인가


이번에 발생한 우한 폐렴은 중국 우한시 화난 해산물 시장에서 처음 발생한 폐렴으로 그 전염성이 매우 강합니다. 원인체로 지목된 것은 신종 코로나 바이러스로 코로나 바이러스가 변이를 일으킨 것입니다. 우한시 화난 해산물 시장에서는 각종 다양한 야생동물들을 판매하고 거래가 되었는데, 이 야생동물을 숙주로 지내던 코로나 바이러스가 변이를 일으켜 인간에게 전파되었을 가능성이 가장 크다고 추정하고 있습니다. 현재까지 알려진 바로는 2015년도 유행했던 메르스보다는 치사율이 낮지만, 전파력은 매우 크다고 알려져 있고, 우리나라를 비롯하여 전 세계적으로 확진자가 계속해서 늘어나는 추세입니다. 신종 코로나 바이러스는 잠복기가 14일 정도로 다른 바이러스들에 비해 길며, 잠복기에도 강한 전파력을 가지고 있어 그 심각성이 더 커지고 있습니다.

코로나 바이러스는 무엇인가

코로나 바이러스(Coronavirus)는 코로나바이러스 과에 속하는 바이러스들을 지칭합니다. 전자현미경으로 보면 바이러스 표면이 돌기처럼 튀어나와 있는 것을 볼 수 있는데, 이것이 왕관처럼 생겼다고 해서 라틴어로 왕관을 뜻하는 'Corona'에서 파생되어 명명되었습니다.


[출처] "크리스천투데이", 2020년 1월 28일 발행, 2020년 2월 14일 접속, https://www.christiantoday.co.kr/news/328396

코로나 바이러스는 총 7종(HCoV 229E, HCoV NL63, HCoV OC43, HCoV HKU1, SARS-CoV, MERS-CoV, 2019-nCoV)이며, 4종은 가벼운 감기 증상만을 일으키지만 3종은 신종 코로나 바이러스를 포함하여 심한 호흡기 질환을 일으킵니다.

이번 우한폐렴의 원인으로 지목된 신종 코로나 바이러스는 초기 '2019-nCoV'로 명명되었지만 지난 11일 세계보건기구(WHO)가 정식 명칭을 'COVID-19'로 결정하였으며, 한글 명칭은 '코로나19'로 결정하였습니다. 'CO'는 코로나(Corona), 'VI'는 바이러스(Vrus), 'D'는 질환(Disease), '19'는 질환이 처음 보고된 연도를 의미합니다.

질병관리본부는 감염증 환자로부터 바이러스를 분리하는 데 성공했으며, 이를 백신이나 치료제를 개발하는 데에 과학계와 공유하기로 했습니다. 한국 분리주 이름은 'BetaCoV/Korea/KCDC03/2020'으로 붙어졌습니다. 질병관리본부가 공개한 바이러스 유전정보에 따르면 분리된 바이러스는 중국(우한, 광동), 프랑스, 싱가포르, 독일 등 국외에서 분리한 바이러스와 염기서열이 99% 일치하는 것을 확인하였으며, 아직까지 특이한 변이가 발견되지는 않았습니다.

현재까지 NCBI에 등록된 2019-nCoV(COVID-19) 염기서열은 50건 정도이며, 318건의 단백질 서열 정보와 112건의 논문이 발표되었습니다.


[2019-nCoV (Accession : NC_045512 / Description : Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome)]

CLC Genomics Workbench를 이용하여 COVID-19(2019-nCoV) 서열을 확인해 보았으며, 해당 서열을 이용하여 BLAST를 실행해 보았습니다.



[NCBI BLAST using CLC Genomics Workbench 20.0]

 

BLAST 결과 COVID-19(2019-nCoV) 중국, 미국을 제외하고 박쥐로부터 유래한 코로나 바이러스와 유사한 것을 볼 수 있었습니다.

인간에게 심한 호흡기 질환을 일으키는 3종의 바이러스(COVID-19(2019-nCoV), SARS-CoV, MERS-CoV)를 NCBI에 등록된 서열 중에서 랜덤으로 몇 개만을 추려 tree를 그려보았습니다.

아래와 같이 분류된 바이러스의 taxonomy 정보에 따라 tree가 그려지는 것을 확인할 수 있었습니다.


[Tree layout : Phylogram]


[Tree layout : Cladogram,  (Create Tree using CLC Genomics Workbench 20.0)]

 

COVID-19 발생 현황

미국의 존스홉킨스 대학에서 WHO, CDC, NHC의 자료를 토대로 신종 코로나 바이러스의 발생 현황을 실시간으로 확인할 수 있는 사이트를 개설하여 전 세계적으로 정보를 제공하고 있습니다. 아래의 사이트를 참고하면 좋겠습니다.


[출처] "Coronavirus COVID-19 Global Cases by Johns Hopkins CSSE", 2020년 2월 14일 접속, https://gisanddata.maps.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/bda7594740fd40299423467b48e9ecf6

최근까지 보도된 자료에 따르면 국내에서의 COVID-19의 확진자는 28명이며, 7명의 확진자(1,2,3,4,8,11,17번)가 퇴원하였습니다. 퇴원한 일부 확진자에게 에이즈(HIV) 치료제를 투약하여 치료 효과가 있었다는 기사들도 많이 보도되고 있지만, 이를 치료제로 쓸 수 있는 과학적인 근거는 아직까진 없다고 이야기합니다. 28번째 확진자가 나타난 이후 추가 확진자가 나오지 않고 있어, 더는 확진자가 늘지 않기를 바랍니다.

예방법

아직은 백신이나 치료제가 없는 신종 코로나 바이러스를 피할 방법은 없을까요? 바이러스의 전파는 주로 비말감염을 통해 이루어집니다. 비말감염이란 재채기나 기침으로 인해 튀는 침방울이 타인에게 접촉되어 감염되는 형태를 말합니다. 우리는 이런 비말감염만 예방하여도 신종 코로나 바이러스로부터 안전할 수 있습니다. 예방할 수 있는 가장 큰 방법으로는 마스크 착용과 손 씻기 입니다.

이처럼 개개인이 할 수 있는 예방법으로는 개인위생을 철저히 하는 방법밖에는 없을 것 같습니다. 질병관리본부에서 제공하는 신종 코로나 바이러스 감염증 예방 수칙을 토대로 나와 타인을 위해 위생에 신경 써주시길 부탁드리겠습니다.


[출처] "질병관리본부" 2020.2.12 발행, http://www.cdc.go.kr/gallery.es?mid=a20503020000&bid=0003





참고문헌

  1. https://terms.naver.com/entry.nhn?docId=5894275&cid=61232&categoryId=61232

  2. https://terms.naver.com/entry.nhn?docId=72940&cid=43667&categoryId=43667

  3. https://www.christiantoday.co.kr/news/328037

  4. https://blog.naver.com/asecino/221788068575

  5. https://news.sbs.co.kr/news/endPage.do?news_id=N1005648026&plink=ORI&cooper=NAVER

작성 : insilicoLab 송하나 선임
 

Posted by 人Co

2020/02/14 14:37 2020/02/14 14:37
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