유전자들로 IPA에 목록을 생성하고 분석을 진행할 수 있습니다. 외부에서 Identifier 목록을 업로드하여 사용할 수도 있습니다.
IPA 내부에서는 다음 도구들에서 목록을 생성할 수 있습니다.

- Search results
- Network List
- Network Explorer
- Neighborhood Explorer
- My Pathways
- Canonical Pathways
- Functional Analysis for a Dataset or for a Network/Pathway
- Molecule View
- Compare Tool

이 도구들을 이용하여 목록이 만들어지면 분자를 선택한 후, Add to List 버튼을 클릭하세요. 이렇게 생성된 목록에서 분석을 진행할 수 있습니다.
Core Analysis를 하려면 다음과 같이 진행하세요.

1. 리스트를 연 다음 우측 상단의 재생 버튼(options icon)을 클릭합니다.
2. Run Core Analysis를 선택합니다. Core Analysis 생성 페이지가 나옵니다.
3. Run Analysis를 클릭합니다.