MUSCLE의 경우 서드파티에서 개발하고 있는 소프트웨어로, 현재 32bit만 지원하고 있는 상태입니다.

32bit의 경우 Windows 자체의 한계로 인해 프로그램 당 최대 4GB RAM 만 사용할 수 있고, MUSCLE은 그 중에서 2GB를 한계로 가지고 있습니다.

따라서 error code 2가 뜨는 경우에는 sequence의 길이를 줄이거나, 개수를 줄이는 방향으로 진행하셔야 합니다.