자주 묻는 질문 | (주)인실리코젠-생물정보 전문기업

Exonic regions에 변이만 테스트 하고 싶습니다. 조회 1153 2021. 05. 28 - 위 그림과 같이 step 3 과정에 Exonic regions에 변이 정보만 테스트 하는 옵션을 설정할 수 있습니다. 그리고 calling 시 PASS가 된 부분만 적용할 수 있는 옵션도 설정 가능합니다.
IPA의 network 그림에서 유전자 상단에 뜨는 숫자를 없애고 싶습니다. 조회 1063 2021. 05. 21 - 네트워크에 숫자가 보이는 것은 transcript 기준으로 DEG 분석 결과를 IPA에 업로드 시 나타나는 현상입니다. 이를 보이지 않게 하는 방법을 알려드립니다. 1. 네트워크 확인 시, Overlay 클릭 2. Analyses, Datasets and Lists 선택 3. 하단의 Display isoform badges on nodes를 체크 해제 4. 해당 이미지를 export할 경우 Export에서 그림을 클릭 (선택 사항)
IPA의 Canonical Pathway에서 z-score의 기준이 무엇인가요? 조회 1369 2021. 05. 21 - Canonical Pathway에서 색깔을 나타나는 것에 대한 전반적인 내용입니다. - Canonical Pathway에서 막대에 색깔이 나타나는 것 (comparison에서 각 heatmap마다의 색깔)은 Pathway Activity Analysis라는 분석이 같이 수행된 결과 - significantly-perturbed genes / proteins / chemical 들의 발현 혹은 인산화를 기반으로 예측을 진행 z-score는 pathway activity를 기준으로 결정됩니다. - 주황색은 pathway activity의 전반적인 증가 - 파란색은 pathway activity의 전반적인 감소 - 회색은 pathway와 관련된 유전자가 4개 미만인 경우 - 흰색은 z-score가 0 또는 0에 매우 가깝거나 pathway와 관련하여 분석된 dataset에 4개 이하의 유전자가 있을 때 하기 링크를 참조하시면 더 자세한 정보를 확인하실 수 있습니다. Knowledge: Canonical Pathways for a Dataset (force.com)
Annotation track 들을 한 화면에 다 보이게하고 싶은데, 어떻게 해야 하나요? 조회 931 2021. 05. 21 - "New | Track list" Tool을 이용하여 한 화면에 보고 싶은 annotation track 들을 선택해서 병합해주면 됩니다.
Annotation 파일에서 특정 annotation만 필터링할 수 있나요? 조회 1194 2021. 05. 21 - "Filter Annotation on Name" Tool을 이용하여 원하는 annotation 리스트만 필터링 할 수 있습니다.

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