자주 묻는 질문 | ㈜인실리코젠-데이터 바이오 기업

IPA에서 metabolomic analysis도 제공하는 것 같은데, 혹시 이 경우에는 대사체의 어떤 것을 넣어서 진행하면 될까요? 조회 2,429 2021. 04. 23 - >> Input으로 CAS Registry Number, PubChem CID, HMDB와 KEGG identifiers 를 지원합니다. >> Core Analysis 진행 시, Metabolomics Analysis를 선택하시고 분석을 진행하시면 됩니다.
PDR score 란 무엇인가요? 조회 2,212 2021. 04. 23 - Phenotype Driven Ranking(PDR)으로 hereditary workflow 에서만 적용 가능하며 PDR score로 변이 리스트를 내림차순으로 정리할 수 있습니다 (Krämer, Andreas, et al. "Leveraging network analytics to infer patient syndrome and identify causal genes in rare disease cases." BMC genomics 18.5 (2017): 15-23). PDR algorithm은 QIAGEN knowledge base(KB) DB를 활용하여 사용자가 제공한 phenotype 정보와 질병 관련 유전자와의 유사성 정도를 점수화 합니다. PDR algorithm은 사용자가 환자의 phenotype 및 symptom 정보를 입력 시에만 사용 가능합니다.
특정 균주를 제외하고 PCoA 분석을 할 수 있나요? 조회 2,347 2021. 04. 23 - 샘플 군집에서 특정 균주를 제외한 후 PCoA 분석 가능하며, abundance table에서 특정 균주만 제외시킨 후 따로 저장한다음, PCoA 분석을 진행하시면 됩니다.
Beta diversity 분석법 중 Bray-Curtis 방법은 어떤 방식인가요? 조회 6,885 2021. 04. 22 - Bray-Curtis 분석 방법 경우에는 taxa 종류와 그 taxa 비율이 얼만큼 인지를 비교하는 방식입니다. 즉, 어떠한 균을 공유하고 있는지 (Qualitative)와 공유하고 있는 그 균의 풍부도 (Quantitative)는 얼만큼 차이나는지를 같이 보는 방식입니다.
Somatic sample에서 Variant List의 각 변이별 tile 정보 해석은 어떻게 하나요? 조회 1,913 2021. 04. 21 - 아래 그림과 같이 somatic variant QCI 결과 Variant List에서 각각의 변이 타일(tile) 오른쪽 위의 기호 의미는 다음과 같습니다. S : 암 관련 승인된 치료법의 민감성과 관련이 있는 변이를 의미 R : 암 관련 승인된 치료법의 저항성과 관련이 있는 변이를 의미 cT : 암환자 관련 임상 시도와 연관 있는 변이 혹은 유전자를 의미 P : 암환자 예후 정보(prognostic)와 관련있는 변이 D : 암환자 진단(diagnostic) 정보와 관련있는 변이 i : Pathogenic과 benign 정보 모두 증거가 있어 어느 하나로 단정 짓기 어려움

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