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CLC Workbench에서 Reference(레퍼런스) 서열 다운로드 방법
조회 706
2018. 01. 15 - CLC Genomics Workbench에서는 많이 사용되는 reference서열을 프로그램 내에서 직접 다운로드 받을 수 있도록 되어있습니다.우측 상단의 'Download' 라는 아이콘을 클릭하셔서 맨 위의 'Download Reference Genome Data...' 라는 메뉴를 선택해 주시기 바랍니다.아래의 분류에서 원하시는 reference genome을 선택하셔서 서열과 annotation 파일을 다운로드 받으시면 됩니다.만약 필요한 서열이 리스트에 없다면 이곳을 클릭하셔서 안내에 따라주시기 바랍니다.
원하는 reference genome 데이터가 없습니다.
조회 1290
2017. 08. 04 - 1. 먼저 NCBI로 접속하셔서 Genome을 선택하신 다음 reference 서열을 원하는 종을 검색하여 주십시오.상단의 박스에 Download sequence에서 genome을 download genome annotation 에서는 GFF를 선택하여 다운로드 해주시기 바랍니다.2. 둘 다 압축을 풀지 않은 상태에서(압축을 풀어도 무관) Import아이콘을 클릭하여 Standard import 혹은 Fasta Read Files...를 선택하여 서열데이터를 import해줍니다. 경고메시지가 나온다면 No를 눌러주세요.3. Annotate with GFF file 툴을 이용하여 import한 서열데이터를 넣고 gff파일을 선택하여(압축여부 무관) 기존의 서열이 annotation을 입혀줍니다.3-1. Annotation with GFF file이 없다면 플러그인을 설치해야 합니다. OS가 윈도우라면 프로그램을 종료하고 CLC Genomics Workbench 아이콘을 선택한 다음 우클릭 하여 '관리자 권한으로 실행'으로 실행시켜 주시기 바랍니다.3-2. 우측 상단의 plugins 아이콘을 선택하여 뜨는 창에서 Download plugins를 눌러주세요.3-3 Annotate with GFF file이라는 플러그인을 찾아 'Download and Install' 버튼을 이용하여 설치해주시고 프로그램을 재실행해주시면 됩니다.
C드라이브 용량 부족으로 다른 드라이브에 저장하고 싶습니다.
조회 909
2017. 08. 04 - CLC Workbench는 기본적으로 C:\의 CLC_Data라는 폴더가 분석 결과파일을 저장하는 폴더의 default값으로 지정되어 있습니다.이를 변경하기 위해서는 먼저 Navigation Area의 두번째 아이콘인 'Add file location'기능을 이용하여 저장하고자 하는 폴더를 추가합니다. 이 때 추가하는 폴더는 다른 드라이브에 생성되어 있는 폴더여야만 다른 드라이브로 저장을 할 수 있습니다.그 다음 메뉴바의 Edit-Preferences로 들어가서 수정을 하시면 됩니다.Preference에 들어가시면 창이 뜨고, 왼쪽 탭에서 Advanced를 선택해주시면 아래와 같은 화면을 보실 수 있습니다.여기서 Default Data Location이라고 되어 있는 부분에 'Add file location'기능을 이용하여 추가하였던 폴더를 선택하시고 OK버튼을 눌러주시면 저장하는 default 폴더가 변경이 될 것입니다.
데이터 백업방법을 알려주세요.
조회 865
2017. 02. 28 - 만약 컴퓨터 이동(Reinstall) 진행 또는 데이터 공유를 위하여 데이터 백업을 해야하는 사항이라면, 총 두 가지(프로그램 내 Export/로컬) 방법으로 백업이 가능합니다.>> 데이터 백업하는 방법
구 버전의 CLC Workbench에서 NCBI Database Search & Downloads 그리고 BLAST를 사용할 수 없습니다. 어떻게 해야 하나요?
조회 964
2017. 02. 07 - 2016년 9월부터 NCBI의 서비스가 'https:' 로 서비스(암호화 강화)가 변경되었습니다. 최신버전에서는 https로 접근이 가능하게끔 업데이트 되어 NCBI download 기능을 이용할 수 있지만, 이전 버전에서는 해당 부분이 업데이트 되어 있지 않아 이용이 어렵습니다. 따라서 CLC Workbench를 최신버전으로 업데이트하는 것을 추천 드립니다.
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