• HGMD에서 관련 변이에 대한 reference 정보의 출처도 확인할 수 있나요? 조회 1456 2021. 02. 26 - 네. 가능합니다 HGMD 결과에서 HGMD accession number 를 이용해서 확인하실 수 있습니다. HGMD accession 정보를 클릭하시면 관련 페이지에 Comments/notes 섹션에서 자세히 어느 부분에 관련 변이가 언급되었는지 확인하실 수 있습니다.
  • miRNA 분석 시 Annotation 파일 관련해서 RNA central mirbase를 어디서 받을 수 있는지 궁금합니다. 조회 1485 2021. 02. 24 - RNAcentral은 별도의 DB이므로 직접 다운로드 받아서 import 해주셔야 합니다. http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/RNAcentral/releases/16.0/id_mapping/database_mappings/mirbase.tsv 위 링크로 받으시면 됩니다. (버전은 업데이트될 수 있으니, 항시 체크해서 받아주세요.)
  • Assembly 이후 각 서열의 peak를 확인하고 싶습니다. 조회 1481 2021. 02. 22 - CLC Workbench에서 assembly 파일을 여신 후, 오른쪽 side panel에서 아래 이미지처럼 설정을 변경해보세요.
  • Search for Sequences at NCBI에서 다음과 같은 에러가 났을 때의 해결 방안을 알려주세요. 조회 1743 2021. 02. 22 - 상단과 같은 에러가 발생하는 원인은 현재 사용하시고 계시는 곳에서 프록시 서버를 통해 인터넷에 접속하는 방식이기 때문입니다. 따라서 해당 망의 프록시 서버 정보를 기관의 전산팀에 문의하신 후 CLC Main Workbench에 기입하여야 합니다.   기입 방법 1. 현재 실행하고 계신 CLC Main Workbench를 종료하신 후 관리자 권한으로 실행해주세요. 2. 상단의 Edit > Preferences를 클릭해주세요. 3. 아래 그림의 네모칸에 Host 정보와 포트정보를 기입하시고 Ok를 누르신 후, CLC Main Workbench를 재시작해주세요. 4. 사용하시고자 하는 tool이 정상적으로 작동하는지 확인해주세요.    
  • HGMD online 의 검색옵션은 어떻게 되나요? 조회 1367 2021. 02. 19 - 5가지 방식의 검색 옵션을 활용하실 수 있습니다 1. Gene symbol search - official HUGO Gene Nomenclature Committee gene symbol 기반으로 검색합니다. 2. Gene description search - Nomenclature Committee 기반으로 gene 검색을 합니다. 3. OMIM number search - OMIM number로 검색하실 수 있습니다. 4. GDB number search - GDB number로 검색하실 수 있습니다. 5. Disease/phenotype search -HGMD에 보고된 변이와 관련된 질병을 검색할 수 있습니다
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