Frequently asked questions | Insilicogen, Inc.

[CLC Genomics Workbench] Count table이 완료되었는데, gene 정보 등이 table에 안나옵니다. 조회 431 2021. 05. 07 - 우선 Reference 파일에 annotation을 진행해주셔야 합니다. 그 다음, annotation된 reference 파일을 이용하여 count table 작업을 수행하시면 원하는 결과를 얻으실 수 있습니다.
[OmicsBox] Omicsbox에서 count table (transcript-level)만들때 gene level estimation을 추가하면 "transcript to gene map file"이 있어야하는데 이건 무슨파일로 어떻게 만드나요? 조회 705 2021. 05. 06 - "Transcript to Gene Mapping File"을 OmicsBox에서 얻으시려면 RNA-Seq De Novo Assembly tool을 이용하시면 됩니다. 하지만 De Novo 분석이 아니신 경우에는 NCBI나 Ensembl에서 reference DB 중 GFF 파일을 이용하여 파일을 만드셔서 이용하시면 됩니다.
[CLC Genomics Workbench] 외부에서 뽑은 DEG 파일을 workbench에 import하여 PCA나 Venn diagram을 그릴 수 있나요? 조회 669 2021. 04. 30 - 불가능합니다. Workbench에서 PCA나 Venn diagram을 그리시길 원하신다면 sequencing raw data부터 workbench에서 다시 분석을 진행해주셔야 합니다.
[CLC Genomics Workbench] 특정 균주를 제외하고 PCoA 분석을 할 수 있나요? 조회 535 2021. 04. 23 - 샘플 군집에서 특정 균주를 제외한 후 PCoA 분석 가능하며, abundance table에서 특정 균주만 제외시킨 후 따로 저장한다음, PCoA 분석을 진행하시면 됩니다.
trial은 어떻게 사용할 수 있나요? 조회 1229 2020. 12. 15 - Workbench를 설치하지 않으신 상태라면 아래 링크를 통해 설치를 진행해주세요. >> Workbench 설치하기 1. 설치된 Workbench를 우클릭 후, 관리자 권한으로 실행합니다. 2. License Assistant 창에서 첫번째 "Request an evaluation license"를 선택하고 Next를 클릭합니다. 3. " Direct Download"를 선택하고 Next를 클릭합니다. 4. Next를 클릭합니다. 5. 해당 창의 모든 정보를 채워넣으신 후 Next를 클릭합니다. 6. 5번까지 모든 단계를 완료하시면 Workbench가 자동으로 실행됩니다.

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