• CLC Workbench 버전 업그레이드 방법 조회 2,437 2021. 02. 04 - CLC Wkrnbench 업그레이드 방법은 MUS 기간에만 사용하실 수 있습니다. 먼저 아래의 링크에서 사용하시는 Workbench 종류에 맞게 trial Download 후 설치를 진행해주세요. >> CLC Workbench 설치방법 1. 설치 후 실행 시 뜨는 License Assistant 팝업 창에서 2번째 "Download a license"를 클릭하고 Next를 클릭합니다. 2-1. 기존에 가지고 계신 라이선스를 동일하게 빈 칸에 기입해주시고 Next를 누르신 뒤, 나머지 과정을 마무리하시면 됩니다.   2-2. 기존 라이선스를 키파일로 등록하신 경우. 동일한 키파일을 사용하시면 됩니다. License Assistant 창에서 3번째 "Import a License from a File"를 선택하고 Next를 클릭합니다. "Choose License File" 을 클릭하신 후 해당 키 파일을 선택하고, Next를 눌러 이후 설치과정을 마무리합니다. 3. path.properties 수정 등 개인적으로 설정을 바꾸신 경우, 21버전에서도 적용하셔야 동일한 환경으로 사용하실 수 있습니다.
  • QCII 에서 변이 정보 데이터베이스인 QIAGEN Knowledge Base 란 무엇인가요? 조회 2,065 2021. 02. 03 - QIAGEN Knowledge Bases는 20년 동안 과학 저널,  molecular content databases 및 textbooks 등을 종합한 DB 입니다.    전문가들의 리뷰 과정을 통해서 매달 4,000건 이상의 큐레이션이 진행되며 매일 3,000개 이상 콘텐츠가 DB에 업데이트됩니다. 콘텐츠에는 Public Database 인 TCGA, ClinVar, dbSNP, 1,000 Genome, genomeAD 등 을 포함하고 퀴아젠 DB인 HGMD, PGMD, Clinical 자료 및 CADD, Polyphen, SIFT 등 존재하는 모든 변이 정보를 담아냈다고 할 수 있을 만큼 방대한 DB입니다. 따라서 어떤 변이를 분류할 때 정확하게 분류할 수 있으며 분석 시간을 단축할 수 있습니다.
  • HGMD 에서 변이는 어떻게 분류하나요? 조회 2,450 2021. 01. 29 - HGMD는 오래전부터 자체적인 classification을 가지고 있습니다. 5가지 분류체계로 DM, DM?, DFP, DP, FP로 구성되어있습니다. 맨 왼쪽 DM부터 질병과 연관이 높은 순으로 마지막 FP는 질병과 연관이 가장 적다고 할 수 있습니다.
  • HGMD 라이선스는 구매 시 검색 기능만 사용 할 수 있는건가요? 조회 1,948 2021. 01. 29 - HGMD 는 online version 과 download 버전이 있습니다. online 버전의 경우 변이의 위치 혹은 유전자 등을 활용하여 검색 용도로 쓰실 수 있고, Download version은  csv 혹은 vcf나 gff 파일 형태로 다운로드 후 대용량 데이터에 annotation 하실 때 주로 쓰실 수 있습니다. 더 자세한 사항은 consulting@insilicogen.com 으로 문의주시면 안내드리겠습니다.
  • Whole meta data의 taxonomic profiling 방법을 알려주세요. 조회 2,265 2021. 01. 28 - 1. Microbial Genomics Module | Databases | Taxonomic Analysis | Download Microbial Reference Database tool을 실행시켜 주십시오. 실행 화면을 살펴보시면, 연구자가 직접 항목을 선택하여 DB를 구축할 수 있고, 모든 컨텐츠가 포함되어 있는 DB도 다운로드 받으실 수 있습니다. 2. 이렇게 DB를 다운로드 받으셨으면, Microbial Genomics Module | Databases | Taxonomic Analysis | Create Taxonomic Profiling Index tool을 실행시켜 주십시오. 위에서 받은 서열을 input으로 넣으신 후, indexing 진행해주시면 됩니다. 3. 이렇게 DB indexing도 끝났으면, Microbial Genomics Module | Metagenomics | Taxonomic Analysis | Taxonomic Profiling tool을 실행시켜 주십시오. input에는 OTU clustering을 진행한 abundance table을 넣으시고, reference index에는 위에서 만든 index 파일을 넣으셔서 분석을 진행하시면 됩니다.
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