• HGMD 에서 2개 이상이 연관된 돌연변이의 표현형을 찾을 수 있나요? 조회 2,035 2019. 07. 12 - 네, 만약 한 논문이 정말로 다른 두개의 표현형(매우 드문 경우)에 의해 발생하는 변이를 보고하는 경우, 이는 질병 분야에 반영되어야 합니다(예 : CM013504 Stargardt disease and macular degeneration). 두 가지 경우(또는 그 이상)의 논문이 동일한 병변을 다른 표현형으로 설명하는 경우, 가장 초기의 보고를 "일차적인" 돌연변이 reference로 기록하고 후속 보고를 "추가 표현형" 이차적인 reference로 추가합니다. 각각의 경우 표현형은 기술되어 있는 reference와 연관이 있습니다. 추가적인 표현형(이차적인 reference로부터의 다른 정보)에 대한 세부사항은 확장된 돌연변이 기록(accession number 버튼을 클릭하여 접근할 수 있음)에서 제공됩니다.
  • 다른 종의 codon table 정보는 어떻게 추가 하나요? 조회 2,138 2019. 07. 08 - CLC Main Workbench에서 코돈테이블 정보는 아래 경로에서 확인해볼 수 있습니다.   C:\Program Files\CLC Main Workbench 8\res\codonfreq 위의 폴더에서 파일을 열어보시면 아래와 같은 형식으로 구성이 되어 있습니다.   새로운 종의 코돈 테이블 정보를 위와 같이 만들어 준 후, 해당 폴더로 저장을 하시면 됩니다.
  • 텍스트 포맷 혹은 csv 포맷으로 발현 데이터를 가지고 있는데, CLC Genomics Workbench에서 분석이 가능할까요? 조회 1,905 2019. 07. 05 - Import를 클릭하신 후, Standard import를 선택합니다. 파일 유형에서 "Generic expression data table format"을 찾아 선택하신 후 파일을 선택하여 import를 이어서 진행해주세요. 텍스트 형태의 발현 파일로 CLC Workbench 내부에서 분석하실 수 있습니다.
  • Gene list만 가지고 분석을 진행할 수 있나요? 조회 2,107 2019. 06. 28 - 유전자들로 IPA에 목록을 생성하고 분석을 진행할 수 있습니다. 외부에서 Identifier 목록을 업로드하여 사용할 수도 있습니다. IPA 내부에서는 다음 도구들에서 목록을 생성할 수 있습니다. - Search results - Network List - Network Explorer - Neighborhood Explorer - My Pathways - Canonical Pathways - Functional Analysis for a Dataset or for a Network/Pathway - Molecule View - Compare Tool   이 도구들을 이용하여 목록이 만들어지면 분자를 선택한 후, Add to List 버튼을 클릭하세요. 이렇게 생성된 목록에서 분석을 진행할 수 있습니다. Core Analysis를 하려면 다음과 같이 진행하세요. 1. 리스트를 연 다음 우측 상단의 재생 버튼(options icon)을 클릭합니다. 2. Run Core Analysis를 선택합니다. Core Analysis 생성 페이지가 나옵니다. 3. Run Analysis를 클릭합니다.
  • 제가 가지고 있는 유전자를 어떻게 추가할 수 있나요? 조회 2,066 2019. 06. 28 - 1. Build 버튼을 클릭하고, pull-down 메뉴에서 Add Molecules/Relationships을 선택하세요. 선택할 molecule type을 캔버스에서 클릭하세요. Molecule type을 모르면 Other를 선택하세요. 2. 분자를 정의하려면 해당 molecule을 우클릭해서 Edit node를 선택하세요. 3. Node의 이름을 입력하세요. 노드는 유전자 이외의 분자, 단백질 등을 입력할 수 있습니다. Search를 클릭하여 Ingenuity knowledge base에 검색을 하거나 우측에 정보를 입력할 수 있습니다.
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