자주 묻는 질문 | (주)인실리코젠-생물정보 전문기업

PetaSuite는 종과 관계없이 압축되나요? 조회 1416 2021. 07. 16 - PetaSuite는 자체 DB인 Corpus가 없는 경우에도 지원하는 데이터에 대해 모든 종을 압축할 수 있습니다. 이는 de novo align된 데이터도 포함되며, 압축 최적화를 위해 corpus 중 가장 근접하게 일치하는 것을 자동 감지할 수도 있습니다.
박테리아 de novo WGS 데이터를 이용해서 gene prediction을 하고 싶습니다. CLC Genomics Workbench에서 가능한가요? 조회 1591 2021. 07. 15 - CLC Genomics Workbench Premium에서 이용 가능하며, CLC Microbial Genomics Module | Functional Analysis | Find Prokaryotic Genes tool을 이용하여 gene prediction 진행해주시면 됩니다.
BLAST at NCBI tool을 이용해서 BLAST 하는데, 100%라고는 뜨는데 결과가 안나옵니다. 조회 1629 2021. 07. 15 - CLC Genomics Workbench에서 1,000,000bp 보다 sequence가 길면 BLAST at NCBI tool을 이용하실 수 없습니다.
PetaSuite에서 지원하는 corpus의 개수는 총 몇 개인가요? 조회 1259 2021. 07. 09 - PetaSuite에서 최적화된 압축을 위해 지원하는 총 corpus(종) 수는 71개입니다. 하지만 corpus가 없더라도 압축을 진행하실 수 있습니다.
BLAST database를 다운받으려는데 기존 경로는 용량이 작아서 경로를 바꾸고 싶은데, 어떻게 바꾸나요? 조회 1468 2021. 07. 08 - 1. BLAST | Manage BLAST Databases -> Add Location 클릭한 다음, 저장할 경로 지정 2. BLAST | Download BLAST Databases -> 추가한 경로로 선택하고 databases 다운로드 진행

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