• [CLC Genomics Workbench] Read mapping에 사용된 총 메모리가 Java 프로세스의 최대값으로 지정된 것보다 많은 이유는 무엇입니까? 조회 1536 2022. 03. 28 - Read mapping 작업을 실행할 때는 3단계가 있습니다.a pre-processing 단계a computational 단계a post-processing 단계The pre- and post-processing 단계는 CLC Java 프로세스의 일부이므로 vmoptions 파일의 Xmx 설정을 사용하여 Java에 배치하는 Heap 크기 제한이 적용됩니다.  Workbench에서 이 설정을 변경하는 방법은 아래에 설명되어 있습니다.Workbench JVM에 대한 메모리 설정 변경메모리 제한은 설정 후 숫자 값과 단위를 부여하여 속성 파일에서 구성됩니다 -Xmx. 예를 들어 다음과 같을 수 있습니다.-Xmx8000m 8000m은 Workbench Java 프로세스가 사용할 수 있는 최대 메모리 양이 8000Mb임을 나타냅니다.새 메모리 제한이 구성된 경우 다음에 Workbench가 시작될 때 적용됩니다.관련 속성 파일의 위치는 사용 중인 운영 체제에 따라 다릅니다.운영체제 별 속성 파일의 위치는 아래 링크를 참조해주시길 바랍니다.http://resources.qiagenbioinformatics.com/manuals/workbenchdeployment/current/index.php?manual=Setting_amount_memory_available_JVM.html그러나 Computational 단계는 기본 Binary를 통해 실행됩니다. 따라서 Java 관련 설정의 영향을 받지 않으며 필요한 메모리 양을 사용합니다.Workbench의 시스템 요구 사항은 아래의 링크 웹사이트에서 제공됩니다(아래 링크 참조). 이 정보에는 특정 샘플 게놈에 대해 Mapping을 실행하는 데 필요한 메모리 양에 대한 안내가 포함됩니다. 필요한 메모리 양은 Mapping 하려는 게놈의 크기와 연결되어 있습니다.https://www.qiagenbioinformatics.com/system-requirements/
  • [CLC Genomics Workbench] CLC Workbench의 메모리 제한을 어떻게 변경합니까? 조회 1581 2022. 03. 28 - 기본 메모리 설정 및 변경 방법CLC Workbench 에서 사용할 수 있는 메모리 양은 소프트웨어 설치 중에 처음에 설정됩니다. Workbench의 경우 권장되는 기본 메모리 양은 사용 가능한 물리적 메모리의 50% 또는 50GB 중 작은 값입니다. 설정을 기본 수준으로 두는 것이 좋습니다.Workbench에서 이 설정을 변경하는 방법은 아래에 설명되어 있습니다.Workbench JVM에 대한 메모리 설정 변경메모리 제한은 설정 후 숫자 값과 단위를 부여하여 속성 파일에서 구성됩니다 -Xmx. 예를 들어 다음과 같을 수 있습니다.-Xmx8000m 8000m은 Workbench Java 프로세스가 사용할 수 있는 최대 메모리 양이 8000Mb임을 나타냅니다.새 메모리 제한이 구성된 경우 다음에 Workbench가 시작될 때 적용됩니다.관련 속성 파일의 위치는 사용 중인 운영 체제에 따라 다릅니다.운영 체제에 따른 속성 파일의 위치는 아래 링크를 참조해주시길 바랍니다.https://resources.qiagenbioinformatics.com/manuals/workbenchdeployment/current/index.php?manual=Setting_amount_memory_available_JVM.html 왜 50%만?Workbench Java 프로세스가 사용해야 하는 최대 메모리 양을 지정하는 기본 설정은 공간이 다른 시스템 작업에 사용 가능해야 하고 특정 Workbench 도구에는 Binary 단계(즉, 일부로 실행되지 않는 단계)가 있다는 사실을 반영합니다. 이러한 도구의 이진 단계는Workbench 프로세스 자체에서 사용하는 것 이외의 메모리를 사용하므로 vmoptions 파일의 메모리 설정에 영향을 받지 않습니다. 이 프로필을 사용하는 도구에는 읽기 매핑 단계(예: Read mapping, RNA seq 분석, small RNA 분석 등) 및 로컬 BLAST 검색이 포함된 새로운 어셈블리 및 분석이 포함됩니다.왜 50GB만?50GB 제한은 Garbage Collecter(GC)로 인한 일시 중지를 방지하기 위한 것입니다. 위에서 언급한 것처럼 외부 Binary를 위한 여유 메모리를 보장하는 것 외에도 JVM이 Garbage Collecter(GC) 프로세스를 실행하는 데 너무 많은 시간을 소비하지 않도록 최대 Heap 공간에 대한 권장 제한이 있습니다. GC는 현재 사용 중인 Heap을 스캔하고 더 이상 사용하지 않는 콘텐츠를 제거하여 메모리를 확보하는 JVM의 메모리 처리 하위 시스템입니다. 최대 Heap이 클수록 Heap을 통한 각 검사가 더 오래 걸립니다. JVM은 GC를 실행하는 동안 다른 모든 활동을 일시 중단해야 합니다. 이러한 일시 중단은 밀리초 에서 몇 초 사이이며 일반적으로 눈에 띄지 않습니다.JVM의 GC 하위 시스템과 함께 CLC Workbench는 정교한 Caching 시스템을 활용하여 불필요한 데이터를 메모리에서 임시 Disk storage로 이동합니다. 이 Caching 시스템의 결과는 50GB보다 큰 Java Heap 공간에서는 눈에 띄는 성능 향상이 없지만 GC 일시 중지가 더 눈에 띄게 될 수 있음을 의미합니다.
  • [CLC Genomics Workbench] Biomedical Genomics analysis Plug in의 Workflow는 모두 CLC Genomics Workbench 내의 Tool 들로 만 구성되어진것입니까? 조회 1407 2022. 03. 21 - biomidical의 Workflow는 CLC Genmomic workbench toolbox를 사용하여 대부분 구성되어있고 특정 workflow에 적합한 Tool을 전용으로 사용 할 때도 있습니다.기본적으로 biomedical genomics analysis plug in은 가장 많이 연구되는 유전 질환 및 암, Sas-cov2, 기타 분석을 즉시 사용 가능한 전용 Workflow입니다.
  • [QDI] QIAGEN Digital Insights 제품 이메일 MFA(Multi Factor Authentication) 관련 문의 사항 조회 786 2021. 09. 27 - QIAGEN Digital Insights customer notification QIAGEN Digital Insights (QDI)에서는 정기적으로 보안 정책을 검토하고 업데이트합니다. NIST(National Institute of Standards and Technology) 보안 지침을 준수하기 위해, QDI는 아래 애플리케이션을 사용하는 모든 고객 계정에 대해 이메일 MFA(Multi Factor Authentication)를 도입하는 단계에 있습니다. • QIAGEN Clinical Insight Translational (QCI-T) • QIAGEN Clinical Insight Interpret (QCI-I) • My QIAGEN Digital Insights (HGMD, PGMD, GenomeTrax, Annovar, COSMIC) • Admin Tool (IAT) • Ingenuity Pathways analysis (IPA)     * For webpage-based login – now till end of 2021     * For webpage and QIAStart login – with the IPA Q4 release    Email Multi Factor Authentication (이메일 다단계 인증)는 위 항목 중 하나에 로그인 후 진행됩니다. 로그인 페이지는 4자리 코드를 입력하도록 안내하는 동시에 사용자에 이메일로 4-digit code가 발송됩니다. 발송된 코드를 로그인 페이지에서 입력하여 일치하면 계속 제품을 사용하실 수 있습니다. Multi Factor Authentication은 브라우저에서 브라우저 쿠키로 사용자에 컴퓨터에 저장됩니다. 쿠키의 경우 삭제되거나 만료되면 새 MFA로 진행됩니다. MFA는 QDI 제품을 활성화하는 것이 아니며 QDI 제품에 대한 액세스를 제한하지도 않습니다. MFA는 무단 액세스로부터 사용자 계정을 보호하는 보안용 입니다. 브라우저나 컴퓨터 또는 브라우저 캐시가 지워지거나 변경되면 MFA가 다시 진행됩니다.   2021년 7월 30일부터 사용자 계정에 Email Multi Factor Authentication이 필요합니다. 이 도입은 몇 개월이 소요되는 과정으로 2022년 1월까지 작업을 완료할 예정입니다. NIST 지침에 따라 QIAGEN Digital Insights는 브라우저 기반의 로그인으로 비밀번호 강제 만료를 중단할 것입니다.  MFA는 비밀번호의 강제 만료를 대체할 예정입니다. QIAGEN Digital Insights는 일부 사용자 계정에 대한 비밀번호 강제 만료를 다시 구현할 수 있는 권한을 가집니다.   Frequently Asked Questions:   Q: 지금 비밀번호를 변경해야 합니까? A: 아니요.   Q: MAF 코드는 얼마나 빨리 전송됩니까? A: 당사 시스템에서 MAF 코드는 즉시 전송됩니다. 그러나, 귀하의 메일 서버 환경에 따라 지연될 수 있습니다.    또한 귀하에 Mailbox가 활성화되어 있는지 확인 부탁드립니다.   Q: MAF 코드는 얼마 동안 유효합니까? A: 현재 MAF 시스템 구축 단계에서는 MAF 코드가 로그인 페이지에 나타난 후 30분 동안 유효하며, MAF 도입 시스템이 완전히 구축되면 5분으로 단축될 예정입니다.   Q: MAF 코드 이메일을 받지 못하면 어떻게 합니까? A: 로그인 페이지에서 "Resend Code" 링크를 클릭해주세요. 이메일이 보이지 않는다면 받은 편지함에서 정크 또는 스팸 폴더를 확인해주세요. 그래도 이메일을 받지 못하셨다면, IT 팀에 문의하여 QIAGEN MFA 이메일이 필터링 되지 않는지 확인해주세요.   Q: 여러 브라우저에서 MFA를 입력하라는 메시지가 표시됩니까? A: 네. MFA 코드는 브라우저마다 고유합니다.     Q: MFA는 얼마 동안 유효합니까? A: MFA 코드를 올바르게 입력하면 60일 동안 유효합니다.     Q: 로그인 페이지에서 MFA 코드에 대한 요청을 계속 받는 이유는 무엇입니까? A: MFA는 컴퓨터의 브라우저에 쿠키로 저장됩니다. 귀하의 기관이 쿠키 저장, 유효성 검사 및 만료에 대한 엄격한 정책이 있을 수 있습니다. 즉, MFA 쿠키가 기본값인 60일보다 빨리 삭제될 수 있습니다.   Q: 로그인을 시도하지 않고 있는데 MFA 코드 이메일을 받았다는 것은 무엇을 의미합니까? A: 이것은 누군가가 귀하의 계정에 귀하로 로그인을 시도하고 있음을 의미합니다.    본사는 이럴 경우, 비밀번호를 변경하고 절대 다른 사람과 공유하지 않을 것을 권장합니다.   Q: MFA 코드를 공유할 수 있습니까? A: 아니요. 각 QIAGEN 사용자 계정은 한 사람을 위한 것입니다. 사용자 계정 공유 또는 암호 또는 MFA 코드는 EULA(최종 사용자 사용권 계약)를 위반합니다.   Q: 비밀번호를 자주 변경해야 합니까? A: 사용자 계정에서 MFA가 활성화되었으면 암호를 변경할 필요가 없습니다.   Q: API를 사용하여 제품에 로그인합니다. MFA 코드는 어떻게 입력합니까? A: 현재 MFA는 브라우저 기반 로그인에만 적용됩니다.   Q: 데이터를 CLC 워크벤치에서 IPA, QCI-T, QCI-I로 업로드하거나 QCI-T에서 IPA로 데이터를 업로드합니다. MFA 코드를 입력해야 합니까? A: 아니요. 이러한 로그인 방법은 향후 MFA를 지원할 예정입니다.   Q: Alissa를 통해 HGMD에 접속합니다. MFA 코드를 입력해야 합니까? A: 아니요. 이러한 로그인 방법은 향후 MFA를 지원할 예정입니다.     NIST의 MFA에 대한 자세한 내용은 아래 링크 참조하십시오. https://csrc.nist.gov/glossary/term/Multi_Factor_Authentication https://www.nist.gov/itl/applied-cybersecurity/tig/back-basics-multi-factor-authentication  
  • [CLC Genomics Workbench] 박테리아 de novo WGS 데이터를 이용해서 gene prediction을 하고 싶습니다. CLC Genomics Workbench에서 가능한가요? 조회 764 2021. 07. 15 - CLC Microbial Genomics Module이라는 플러그인을 구매하시면 이용 가능하시고, 구매를 하셨다면, Microbial Genomics Module | Functional Analysis | Find Prokaryotic Genes tool을 이용하여 gene prediction 진행해주시면 됩니다.
Showing 5 of total 172 records
  • 1
  • 2
  • 3
  • ...
  • 35
  • 다음 페이지