• [CLC Genomics Workbench] Sequencing 결과에서 Total base와 Total reads가 의미하는 것이 무엇인지요? 조회 741 2021. 05. 14 - Total bases : 총 염기 개수 (nucleotide 개수) Total reads : 총 read 개수    아래 서열로 reads와 bases 개수를 구해보면,   >read1 agctagctgagctagc   >read2 cgatcgatcgtaggcatgc   >read3 tagtgctagctagctagctg   Total bases : 56 Total reads : 3
  • [CLC Genomics Workbench] miRNA 분석 시 Annotation 파일 관련해서 RNA central mirbase를 어디서 받을 수 있는지 궁금합니다. 조회 692 2021. 02. 24 - RNAcentral은 별도의 DB이므로 직접 다운로드 받아서 import 해주셔야 합니다. http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/RNAcentral/releases/16.0/id_mapping/database_mappings/mirbase.tsv 위 링크로 받으시면 됩니다. (버전은 업데이트될 수 있으니, 항시 체크해서 받아주세요.)
  • [CLC Genomics Workbench] CLC Genomics Workbench에 있는 miRbase organism이 human으로 되어있던데, mouse는 없나요? 조회 587 2021. 01. 28 - 일단 CLC Genomics Workbench에는 homo sapiens organism miRbase만 있는 것으로 확인되었습니다. 허나, 그 안에 mus musculus 관련 서열도 포함되어 있는 것을 확인하여 mouse 분석을 진행하실 때, 해당 miRbase로 진행하시면 됩니다.
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