CLC bio사와 IBM사가 함께 Combined turnkey genomics sequencing analytics solution을 발표하였습니다.
IBM and CLC bio deliver combined turnkey genomics sequencing analytics solution
2013년 4월 9일
메사추세츠주 보스턴에서 열린 Bio-IT World conference에서 IBM사와 CLC bio사가 협력하여 turnkey next generation sequencing data analytics solution을 발표하였습니다. Combined platform은 진보된 IBM 하드웨어를 기반으로 하여 큰 사이즈의 genomics sequencing data 분석을 위한 CLC Genomics Server 소프트웨어, high-throughput sequencing data의 visualizing, comparing, analyzing을 위한 CLC Genomics Workbench client 소프트웨어가 통합된 scalable end-to-end solution입니다.
"고객에게 효율적인 지원 및 next generation sequencing workload를 수행할 수 있는 platform을 제공하는 것은 중요합니다. Molecular biologists와 clinicians는 personalized medicine의 가능성을 실현시킬 수 있는 이러한 tools를 필요로 하기에 우리는 CLC bio사와 함께 강력한 turnkey generation sequencing data analysis solution을 제공하려 합니다" 라고 IBM사의 World-wide Deep Computing의 Director인 Janis Landry-Lane이 말했습니다.
CLC bio사의 Global Partner Relations의 director인 Mikael Flensborg가 덧붙여 말했습니다. “우리의 bioinformatics 소프트웨어와 IBM사의 훌륭한 하드웨어가 결합하여 high-throughput sequencing data를 분석할 수 있는 turnkey platform을 제공할 수 있게 되었습니다.
Cluster computer nodes는 Intel® Xeon® E5-2650 processors로 실행되는 IBM System x® 3550 M4 rack servers입니다. Nodes는 block과 file workloads를 통합한 storage system이 첨부되어 있는 IBM Storwize® V7000 Unified network에 연결되어 있습니다. Storwize V7000 Unified systems은 IBM General Parallel File System (GPFS™)을 이용한 file data storage를 지원합니다. GPFS는 선도적인 file system performance을 가지고 있고 세계에서 가장 큰 HPC installations에서 이용되고 있습니다. GPFS와 함께 CLC bio 소프트웨어는 최적화된 performance를 위해 NGS data에 빠르고 믿을 수 있는 접근을 제공하는 shared-disk file management solution을 레버리징하고 있습니다. Turnkey analysis platform은 8 CPU cores, 192 GBs의 메모리에서 192 CPU cores, 768 GBs의 메모리, 고객마다의 분석요구사항에 따라 맞춰진 범위 이렇게 3종류의 configurations를 가지고 있습니다.
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