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Danish HQ moves to landmark building in Aarhus
CLCbio사의 엄청난 성장으로 인하여 CLCbio 본사가 Aarhus에서 랜드마크인 고층 사무빌딩 Prismet으로 이전하였습니다. 장기간 세일즈에서 좋은 수익을 거둔 덕분에 거대한 성장을 할 수 있었으며, CLCbio사의 직원수가 2년전과 비교하여 전세계적으로 50%이상 증가하였습니다.
Read the official press release
Watch CLCbio's video for a first peek at the new location
Cancer seminar in Paris
NGS data의 분석과 visualization에 관한 내용으로 6월10일 ESHG 컨퍼런스에서 워크샵을 진행합니다. Human genetic variants의 비교 및 확인을 위해 human genetic data를 어떻게 분석하는지에 대한 내용을 다룹니다.
Workshop on genome finishing tools before SFAF
CLCbio사의 워크샵에서 CLC Genomics Workbench의 플러그인인 CLC Microbial Genomics Finishing Module을 소개할 예정입니다. CLC Microbial Genomics Finishing Module을 실제로 체험해보고 싶으시다면 망설임 없이 등록하시길 바랍니다.
CLC Microbial Genomics Finishing Module은 identify, visualize를 하는 다양한 tool이 결합되어 있으며 de novo assembly에서의 문제점을 해결할 수 있도록 하여 genome finishing을 하는데 소모되는 시간을 단축시켜 드립니다.
Find the workshop details here
Science
Doubly heterozygous LMNA and TTN mutations revealed by exome sequencing in a severe form of dilated cardiomyopathy
European Journal of Human Genetics (2013), 1-7
Roberta Roncarati et al.
Familial dilated cardiomyopathy (DCM, 가족의 확장형 심근병증)의 유전학은 매우 복잡하며, heterogeneous disease로 질병을 유발하는 유전자가 30개 이상 발견되었습니다. 그러나 가족 내 변동성의 원인은 여전히 알려지지 않았습니다.
최근의 연구에서 whole-exome sequencing을 이용하여 임상적 변동성의 원인을 14명의 피실험자 가족을 통하여 조사하였습니다. CLC Genomics Workbench의 quality trimming, read mapping, variant calling을 이용하여 paired-end reads를 분석하였습니다.
Tutorial
Genome finishing with no reference
Technical writer인 Bodil Øster가 reference가 없을 때 finish a microbial genome을 수행하는 방법에 대한 팁과 비법을 소개합니다.
New Plugins
Metadata import plugin
Metadata를 imort할 수 있도록 도와주는 plugin을 릴리즈하게 되었습니다.
지금까지는 손으로 직접 metadata description을 각각의 sequence에 추가해야하는 불편함이 있었지만 이 plugin을 사용하면 excel 또는 다른 소프트웨어에 기록되어 있는 tabular file을 바로 CLC Workbench로 import할 수 있습니다.
이 plugin은 CLC Main Workbench, CLC Genomics Workbench에 설치가 가능하며 현재 베타버전으로 릴리즈 되었습니다.
Get more details on import of metadata
Local realignment plugin
Read mapping data sets의 alignment quality를 높일 수 있도록 구성된 plugin입니다.
Raw sequencing data를 respective reference genome에 read mapping하면 insertion 또는 deletion이 포함된 artifacts를 생성합니다. Local Realignment는 이러한 alignment artifact를 찾아 제거하여 보다 더 정확한 데이터를 생성할 수 있도록 도와줍니다.
Get more details on Local realignment plugin
