- [릴리즈] BIOBASE, 2014.4 Product Release! 공유
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BIOBASE 사에서는 아래와 같은 내용으로 릴리즈를 하였습니다.
더 자세한 내용은 링크된 주소를 참고하세요.
HGMD Professional
HGMD Professional 2014.4 출시가 되면서 3,500건 이상의 새로운 돌연변이 데이터가 추가되었을 뿐 아니라 기존의 빨간색이었던 DM variant 돌연변이 색표시를 노란색으로 변경하였습니다.
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PGMD
분기마다 정기적으로 하는 업데이트와 hg19 genomic coordinate에서 hg38 genomic coordinate로의 변환 뿐 아니라 FDA 약물 레이블에서 큐레이션된 연구를 도입했습니다.
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Genome Trax
중요한 몇 가지 트랙들을 업데이트했고 hg38 coordinate를 도입했습니다.
12월 말까지는 가능할 수 있도록 진행중 입니다.
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ANNOVAR
ANNOVAR의 새로운 버전은 11월에 발표했습니다. 이번 업데이트에서는 annotation 필터링에 사용하는 메모리를 상당히 감소시켰고, 토마토 같은 다른 방식의 크로모좀 이름의 호환성을 개선했고, reverse strand에서의 splice variant의 엑손 넘버링에 대한 문제를 해결했습니다.
다음과 같이 몇 개의 데이터베이스가 업데이트되었습니다.
-2014년 11월 5일
hg18/hg19의 refGene, knownGene과 ensGene파일이 다운로드 가능합니다.
-2014년 11월 1일
AFR, AMR, EAS, EUR, SAS를 포함한 인종들의 ChrX, chrY 마커가 포함되어 있는 1000 Genomes Project 2014Oct 버전 다운로드 가능합니다. 또한 AFR, AMR, EAS, FIN, NFE, OTH, SAS를 포함한 인종들의 ExAC65000 exomes allele frequency 데이터도 다운로드 가능합니다.
-2014년 10월 2일
ClinVar 20140929(hg19) 다운로드 가능합니다.
TRANSFAC/PROTEOME
정기적인 분기별 업데이트 외에도 TRANSFAC® 프로모터에서 hg19 genomic coordinate에서 hg38 coordinate로의 전환과 binding site를 포함한 특징들을 추가했습니다.
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BRENDA
BREANDA의 최신 버전은 1월에 사용 가능합니다.