GeneCodes사에서는 아래와 같은 내용으로 Sequencher 5.4.1버전을 출시하였습니다.
2015년에 구매하신 분들은 Sequencher 5.4.1로 업그레이드가 가능합니다.
초기엔 Sequencher은 Sanger Sequence 분석을 진행하는데 아주 강력한 툴로 알려져있었습니다.
그리고 나서 NGS와 RNA-Seq command-line tool을 쉽게 이용할 수 있도록 직관적인 interface를 제공하였습니다.
Sequencher 5.4.1로는 Fasta 시퀀스 파일에서 영구적인 reference database와 인덱스를 생성할 수 있습니다. 이것은 reference sequence(최대 BWA-MEM은 10gb까지, GSNAP은 232bp까지) whole genome을 align이 가능하다는 것입니다. 한번 indexing 또는 database를 만들어놓으면 align을 여러 번 할수 있다는 장점에서 많은 시간을 단축시킬 수 있습니다.
Sequencher Connections는 2개이상의 분석들을 쉽게 동시에 진행 할 수 있습니다. Sequencher Connection의 가장 인기있는 기능은 multiple BLAST search을 수행할 수 있다는 점입니다. 그리고 NCBI BLAST나 Local BLAST 뿐 아니라 본인의 sequence로 Primer-BLAST도 search가 가능합니다.
새로운 Primer Picker tab은 Sequencher Connection에서 Primer-BLAST를 이용할 때 primer을선택하게 해줍니다. 그리고 본인의 Sequencher project에서 선택된 primer로 primer-BLAST prediction을 해줍니다. selected primer sequence는 자동적으로 Primer 특징 key로 표시가 됩니다.
> Sanger 와 NGS DNA sequence 분석해주는 소프트웨어, Sequencher 5.4.1 Trial 및 다운로드