[릴리즈] CLCbio, CLCbio and Korilog release KLAST software plug-in for fast, accurate sequence similarity search in next-generation sequencing 공유
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CLCbio사에서는 CLC Main Workbench 및 CLC Genomics Workbench에서 사용가능한 KLAST 플러그인을 릴리즈 하였습니다.

 

  • KLAST가 CLC Workbench의 플러그인으로 릴리즈 되어 기존 BLAST와 비교하여 25배 더 빠르게 분석을 수행할 수 있습니다.

  • CLC Genomics Workbench를 구매하시면 KLAST(4 core) 플러그인을 무료로 제공해드립니다.

 

CLCbio사에서는 Korilog사와의 협력을 통해 CLC Genomics Workbench와 CLC Main Workbench의 플러그인으로 KLAST를 릴리즈하였습니다. KLAST는 서열간의 유사성을 비교 검색하는 툴로써, BMC Bioinformatics에서 만든 PLAST 알고리즘의 실행속도를 최적화 하였습니다. KLAST는 현재의 standard BLAST와 유사한 정확성을 가지면서 25배 더 빠른 속도를 제공하며, 단일수행으로 sequence databanks의 두 개의 large sets 비교 분석을 지원합니다.

 

CLCbio사의 Mikael Flensborg는 “KLAST 플러그인이 CLC Genomics Workbench로 통합되어 대용량 데이터에 대한 염기서열 유사성 비교분석을 보다 빠르게 진행 할 수 있습니다. KLAST는 사용자에게 신속성, 정확성을 가지고 그들의 연구를 수행할 수 있도록 지원할 뿐 아니라 사용자에게 친숙한 그래픽 인터페이스를 제공합니다.” 라고 말했습니다.

 

Korilog사의 Patrick Durand는 “CLCbio사의 시장을 주도하는 bioinformatics platform과 함께 하게 되어 매우 기쁩니다. KLAST가 매우 짧은 기간동안 사용가능 했음에도 불구하고, 많은 연구자들이 NGS applications에 대한 새로운 tool(KLAST)를 사용을 했습니다. 사용자들이 더 많은 옵션을 이용할 수 있도록 지원할 수 있기를 기대하고 있습니다.”

 

KLAST의 logic은 BLAST와 다르며, multi-threading과 SSE instructions를 이용한 비교분석법을 통해 BLAST보다 더욱 높은 분석력을 지원합니다.

 

 

> KLAST 소개 및 다운로드

 

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