- [뉴스레터] CLCbio, Analyze RNA-Seq data in CLC Cancer Research Workbench 공유
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CLCbio사에서는 아래와 같은 내용으로 9월 월간뉴스를 발표하였습니다.
더 자세한 내용은 링크된 주소를 참고하세요.
News
CLC Cancer Research Workbench에서 RNA-Seq 데이터 분석하기
최근 업데이트된 Cancer Research Workbench를 이용하여 DNA-Seq과 RNA-Seq 데이터를 분석 할 수 있습니다.
새로운 기능과 개선된 기능을 사용하고 싶으신 분은 아래의 링크를 통해 다운로드 받으실 수 있습니다.
New variant detection tools
Genomics Workbench와 Cancer Research Workbench에서 variant를 탐지하는 새로운 도구 Basic, Fixed Ploidy, Low Frequency Variant Detection을 추가하였습니다.
Low Frequency Detection 도구는 암샘플 같은 여러 조직이 섞여있는 샘플의 분석에 적합합니다.
> Read more about the three tools
Making big data accessible
Ayasdi와 함께 CLC bio사는 크고 복잡한 데이터를 간단하고 작은 데이터로 바꿀 때의 문제점을 풀기 위해 한걸음 나아갔습니다.
CLC bio사는 지금 Ayadi Cure 응용프로그램과 생물정보학 솔루션의 완벽한 통합을 제공합니다.
Science
Rab25 Is a Tumor Suppressor Gene with Antiangiogenic and Anti-Invasive Activities in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
Cancer Res November 15, 2012 72; 6024 doi: 10.1158/0008-5472.CAN-12-1269 Man Tong et al.
비암세포와 식도 편평세포 암(ESCC)의 임상샘플의 고처리용량(High-throughput) 전사체 시퀀스 프로파일링이 발현상 차이가 많이 나는 유전자들을 밝혔습니다.
Sequencing reads은 CLC Genomics Workbench를 이용하여 human genome에 mapping 하였습니다.
Tutorial
Introduction to CLC Genomics Workbench
CLC Genomics Workbench 7.5 버전에 대한 소개자료입니다.