- [릴리즈] What’s new in the QIAGEN IPA Spring 2020 Release 공유
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새로운 점 : Activity plot과 추가 사항
바이오 마커 발견, 약물 용도 변경, 생물학적 메커니즘 설명 등을 돕는 산점도(scatter plot)를 사용하여 IPA에서 OmicSoft 분석(> 60,000개)을 통해 특정 실체 (upstream regulator, canonical pathway 등)의 활동을 탐색하여 발견합니다. Analysis Match 라이선스가 필요합니다.
Analysis Match 데이터베이스에 있는 6만 개 이상의 분석을 통한 상피간엽이행(EMT) 기능의 활성 예측
EMT는 3,500여개 이상의 분석 (각 분석은 plot의 점으로 표시되며, 제목에서 나타남)에서 특이적입니다. 이 부분집합에 대해 [SF-C1]을 선택하고 비교 유형인 "실험군 vs 대조군" 에 대해 추가적으로 필터링한 결과는 EMT에서 강한 억제(z-score < -2)를 나타냅니다. (이미지 상의 연두색 점)
융합 유전자를 네트워크나 경로 상에서 시각화하세요.
암 작동원리를 네트워크와 경로에서 융합 유전자의 시각화로 설명하세요.
비어있는 경로에서 BCR-ABL1 융합 유전자를 추가하여 생성된 작은 네트워크
다른 분자, 경로 및 질병들의 부분집합들은 융합 유전자의 상위 및 하위의 네트워크에 확장되어 추가되고, Molecule Activity Predictor tool을 사용하여 imatinib 약물을 시스템에 첨가하는 것을 시뮬레이션 하였습니다. "표준" 유전자에 사용 된 것과 동일한 유형의 관계가 융합 유전자에 사용됩니다.
QIAGEN Land Explorer의 통합으로 방대한 오믹스 데이터를 탐색하세요
IPA에서 Land Explorer 전체로의 링크를 통해 생물학적 맥락에 대한 오믹스 데이터의 거대한 데이터베이스를 살펴보세요. Land Explorer 라이센스가 필요하지만, 2020 년 3월 29일부터 30일 동안 무료로 제공되는 Land Explorer trial에 자동 등록됩니다.
QIAGEN Land Explorer가 QIAGEN IPA에 통합됩니다.
이러한 확장은 전반적인 오믹스 데이터에 대한 개별 유전자의 심층적인 탐구, 유전자 간 발현 상관관계, Analysis Match 데이터셋의 expression details 시각화를 가능하게 합니다.
컨텐츠 향상과 업데이트
- 6만 개 이상의 Analysis Match 데이터셋
- 약 139,000개의 새로운 발견, 총합 >7백만 개 이상
- 확장된 Canonical Pathways
- 5개의 새로운 경로
- 10개의 기존 경로가 이제 활성화 패턴을 가짐