- [릴리즈] What’s new in the QIAGEN IPA Fall 2020 Release 공유
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QIAGEN IPA의 가을 릴리즈가 출시되었고 새로운 기능은 다음과 같습니다.
이 IPA 릴리스의 새로운 모습에는 IPA의 주요 기능에 대한 빠른 개요를 확인하는 데 도움이 되는 새로 디자인된 빠른 시작 창과 유익한 짧은 비디오가 포함되어 있습니다.
또한 IPA에 더 선명한 그래픽, 새로운 아이콘 및 더 선명한 글꼴을 제공합니다.
IPA의 새로운 모습. 거의 모든 기능이 친숙한 모습이지만 업데이트 된 모습입니다.
Mac 사용자는 IPA를 사용할 때 macOS 용 기본 명령 키 수정자(native command key modifier)를 사용하여 전환해야 합니다.
예를 들어 네트워크의 모든 노드를 선택하려면 Mac의 경우 키보드에서 ⌘ - A를 누릅니다. (Windows에 사용되는 control - A대신)
최신 IPA 설치 프로그램이 이 릴리스와 호환될지라도 새 앱 아이콘을 얻으려면 최신 IPA 설치 프로그램을 다운로드하는 것을 권장합니다.
: https://analysis.ingenuity.com/pa/installer/select
또한, 이 IPA를 실행하려면 Java 8 이상(설치 프로그램에 내장됨)이 필요합니다.Quick Start window으로 빠르게 방향 잡기
IPA Quick Start window은 당신이 IPA를 효과적으로 사용할 수 있도록 유용한 설명과 링크를 제공하게재구성 되어왔습니다.
이곳에서는 다양한 데이터 유형을 분석하는 방법, 상위 도움말 문서에 대한 링크, 새로운 사례 연구, IPA의 주요 기능에 대한 바로 가기, 지원에 문의하는 방법 등에 대한 섹션을 찾을 수 있습니다.
새로운 Quick Start window. Quick Start window의 왼쪽에 있는 항목은 사용 가능한 콘텐츠에 대한 개요를 제공 : 콘텐츠를 보려면 헤더를 클릭합니다. 이 창을 열려면 도움말 > 빠른 시작으로 이동하거나 Windows의 경우 키보드에서 control-9을, Mac의 경우 ⌘-9를 누릅니다.
Core Analysis 및 My Pathways에 대한 새로운 짧은 비디오
핵심 분석 탭에서 새로운 짧은 비디오에 액세스 할 수 있습니다. 비디오를 보려면 비디오 재생 버튼 아이콘을 클릭하십시오. 이 아이콘은 대부분 탭의 오른쪽 모서리에 표시됩니다. 예를 들어, 다음은 IPA의 Upstream Regulators에 대한 비디오가 있습니다. 이렇게 My Pathway 창에 대한 새로운 개요 비디오도 사용할 수 있습니다.
그래픽 요약
새로운 IPA 그래픽 요약은 IPA 핵심 분석의 주요 생물학적 테마에 대한 빠른 개요를 제공하고 이러한 개념이 서로 어떻게 관련되어 있는지 보여줍니다. 이 기능은 분석에서 예측된 가장 중요한 요소들의 하위 집합을 선택하고 연결하여 일관되고 이해하기 쉬운 분석 개요를 만듭니다.
그래픽 요약에는 canonical pathways, upstream regulators, diseases and biological functions과 같은 요소들이 포함될 수 있습니다.알고리즘은 기계 학습 기술을 사용하여 요약을 구성하고 요소들의 우선 순위를 지정하고 연결하고 QIAGEN Knowledge Graph의 결과로 아직 연결되지 않은 엔티티를 연결하는 관계를 추론합니다. 이러한 추론된 관계는 관련된 생물학적 활동을 시각화 하는데 도움이 됩니다.
그래픽 요약 탭은 핵심 분석 창에서 사용할 수 있습니다. 아래의 예는 덜 공격적인 luminal A type 유방암 세포주와 비교 된 공격적인 "claudin-low"유방암 세포주의 발현 분석에 대한 그래픽 요약 결과를 보여줍니다.
PMID 20813035를 기반으로 하는 이 데이터 세트 에서 claudin-low cells의 상피-간엽 전이 (EMT)는 ZEB1, SNAI1 및 SNAI2와 같은 특정 전사 인자에 의해 활성화되었으며 세포는 조직 침습 경향을 나타냅니다. 이들은 전부 생성된 summary에 나타납니다.
새로운 그래픽 요약은 Core Analysis의 상위 결과를 소규모 네트워크로 요약한 것입니다.
이 기능의 알고리즘은 기계 학습을 포함한 여러 방법을 사용하여 가장 많이 예측되는 항목을 선택하고 연결합니다. 이 릴리스 이전에 실행된 분석은 IPA가 그래픽 요약에 표시된 네트워크를 생성하고 저장하기 때문에 처음으로 볼 때 열기에 조금 더 오래 걸립니다.요약은 여러 요소를 고려하며 이 도움말 문서에 자세히 설명되어 있습니다 . 원하는 경우 더 많거나 더 적은 노드가 있는 새 요약을 생성할 수 있으며 이러한 변경 사항은 분석과 함께 자동으로 저장됩니다.
My Pathway에 직접 "스티커"메모 추가
이 릴리스에서는 관심있는 아이디어나 세부 정보를 캡처하는 데 도움이 되도록 네트워크 또는 경로에 "sticky" 메모를 원하는 만큼 추가할 수 있습니다. 경로 또는 네트워크에 메모를 추가하고 "My Pathway"로 저장하기만 하면 됩니다. 이 도구는 다른 사용자에게 사용자 지정 경로의 구성 요소를 설명하는 데 유용합니다.
경로와 네트워크에 자신의 메모를 추가하여 보다 효과적으로 의사 소통합니다. 자신을 위해 메모하거나 다른 사람과 공유할 수 있습니다. 개별 분자 및 관계에 대한 메모를 첨부하거나 경로에 대한 일반적인 정보를 제공할 수 있습니다. 주석이 달린 경로를 저장하거나 동료와 공유하세요.
콘텐츠 업데이트
- 4 개의 새로운 Canonical Signaling Pathways
- 코로나 바이러스 복제 경로
- 종양 미세 환경 경로
- 암세포 경로에서 MSP-RON 신호
- 대식세포 경로에서 MSP-RON 신호
- 기존의 두 가지 Canonical Signaling Pathways에 활동 패턴 추가
- 적혈구 생성 촉진 인자 신호 경로
- Stathmin1에 의한 유방암 규제
~ 425,000개의 새로운 발견 (IPA에서 총 760 만 개 이상)
이제 Analysis Match 및 Activity Plot에서 73,000 개 이상의 OmicSoft 분석을 사용할 수 있습니다.
Analysis Match 및 Activity Plot의 OmicSoft 분석 콘텐츠. 이 릴리스에는 7,700 개 이상의 새로운 분석이 추가되었습니다.
자세한 내용은 릴리스 정보 를 참조하세요.