What’s new in the QIAGEN IPA Spring 2021 Release 공유
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90,000개 이상의 Analysis Match 데이터세트 컬렉션에서 관련 분석을 쉽게 찾을 수 있습니다.

이제는 필터링 및 사용자 지정 가능한 메타데이터 열을 사용하여 보거나 오버레이 할 분석 및 데이터세트를 검색하는 것이 훨씬 쉽고 정확합니다. 프로젝트 검색에서 관심있는 키워드를 단순히 입력하신 후, 메타데이터 열 위의 필터를 사용하여 원하는 대로 결과를 좁히실 수 있습니다.

Figure 1. 데이터 검색 및 분석에는 검색 및 필터링을 위한 새로운 옵션이 있습니다. 예시는 NASH의 마우스 간의 연구를 찾기 위한 검색을 보여줍니다.

강화된 세포 내 위치 찾기를 통해 생물학을 설명하세요.

단백질의 세포 내 위치는 세포에서 기능과 역할에 대한 단서를 제공할 수 있습니다. 예를 들어, 미토콘드리아에서 발견되는 단백질은 라이소좀에서 발견되는 것과는 다른 역할을 합니다.

이제 모든 네트워크 또는 경로에서 분자의 상세한 세포 내 위치를 자동으로 발견하고 주석을 달 수 있습니다.

Figure 2. 세포 내 위치 정보를 표시하도록 구성된 경로

Figure 3. Figure 2의 경루에서 골지체에 국한된 단백질을 보여주는 세부 사항.

다른 애플리케이션 개선 사항

  1. Genes and chemicals에 대한 자동 완성 기능이 개선되었습니다.
  2. Gene Views, Chem Views, Canonical Pathway Reports 등이 새로운 모양과 느낌으로 업데이트 되었습니다.

Figure 4. Gene View의 새로운 모습

콘텐츠 업데이트

새로운 QIAGEN OmicSoft Single Cell Land 및 SARS-CoV-2 데이터세트는 현재 Analysis Match에서 사용할 수 있는 90,000개 이상의 데이터세트에 포함되어 있습니다.

새로운 2개의 Canonical Signaling Pathways

  1. 확장성 심근병증 신호 전달 경로 (Dilated Cardiomyopathy Signaling Pathway)
  2. NAD 신호 전달 경로(NAD Signaling Pathway)

4개의 기존 Canonical Signaling Pathways에 활동 패턴 추가

  1. 자가포식(Autophagy)
  2. T 세포 수용체 신호(T Cell Receptor Signaling)
  3. 활성 및 무반응 T 림프구에서 IL-2 발현의 조절(Regulation of IL-2 Expression in Activated and Anergic T Lymphocytes)
  4. 수지상세포 성숙(Dendritic Cell Maturation)

업데이트된 1개의 Canonical Signaling Pathway

  1. 코로나바이러스 발병기전 경로(Coronavirus Pathogenesis Pathway)

다음을 포함한 12만 개 이상의 새로운 발견 (IPA에서 총 780만 개 이상)

>37,000 expert findings

>39,000 protein-protein interaction findings from BioGRID

>22,100 cancer mutation findings from ClinVar

>12,700 findings from the Mouse Genome Database (MGD)

>5600 findings from the Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM)

>2200 Gene Ontology findings

>3600 drug-to-disease findings from ClinicalTrials.gov

>3900 target-to-disease findings from ClinicalTrials.gov

273 newly mappable chemicals

Figure 5. ‘Analysis Match’와 ‘Activity Plot’에서 사용할 수 있는 OmicSoft 분석 콘텐츠.

 

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