[릴리즈] New 2019.2 databases release and other news from geneXplain
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2019. 05. 10 -
TRANSFAC 2019.2에서는 다음과 같은 새 기능을 만나 보실 수 있습니다:
- 1,785개의 메틸화/비메틸화 결합 모티프 매트릭스. 대표적인 메틸화 모티프 선별을 바탕으로, MATCH와 함께 사용될 특정 매트릭스 프로파일도 추가되었습니다.
- 19,152개의 Drosophila melanogaster 프로모터가 virtual TSS calculation에 의해 정의되었고, 470개의 전사인자 결합 부위 ChIP-Seq 실험이 modENCODE와 modERN에 배포되었습니다.
- 1,007개의 새로운 전사인자 결합 부위가 Human, mouse, rat, 그리고 pig과의 상보적인 서열을 기반으로 추가되었습니다.
- ENCODE로부터 새로운 human ChIP-Seq 실험이 추가되었습니다.
- Ensembl release 95의 Human, mouse, rat, 돼지, 마카크원숭이, 초파리와 애기장대의 유전자, 프로모터, ChIP 단편의 유전정보가 업데이트 되었습니다.
TRANSPATH® 2019.2에서는 다음과 같은 새 특성을 만나 보실 수 있습니다:
- 18,807개의 human 또는 mouse의 단백질 사이의 새로운 결함 반응이 추가되었습니다.
- 5,071개의 기존 반응이 주요 문헌의 추가적인 실험적인 증거들과 함께 업데이트 되었습니다.
- Pathway 검색 결과가 이제는 pathway name, 관련 분자의 개수와 함께 / 따로 확인할 수 있습니다. 이런 검색 결과의 view는 시각화를 시작하기 전에 pathway의 크기를 평가하는데 도움이 됩니다.
HumanPSD™ 2019.2에서는 다음과 같은 새 특성을 만나 보실 수 있습니다:
- 204,740개의 임상 실험-약물 평가를 담고 있는 새로운 임상 실험 데이터와 전체 401,826개의 임상 실험-질병-약물평가 데이터
- Human Protein Atlas에서 human 단백질의 세포 내 위치 데이터는 Gene Ontology Cellular Compartment 용어를 사용하여 12,073개의 observation으로 통합되었습니다.
데이터베이스 2019.2 배포판이 geneXplain® 플랫폼에 통합되었습니다.
- geneXplain® 플랫폼에서 여러분들의 분석에 TRANSFAC®, TRANSPATH®, HumanPSD™ 2019.2 배포판 데이터베이스를 사용하실 수 있습니다.