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[뉴스레터] QIAGEN QDI 솔루션 9월호 조회 897 2021. 09. 09 - 예정된 웨비나 OmicSoft 스튜디오 웹 세미나 QIAGEN Omicsoft Studio를 사용한 발현 데이터 분석 내용 : • 정규화된 또는 원시 카운트 데이터(전사체학, 단백질체학, 대사체학 등)를 QIAGEN OmicSoft Studio로 가져오기 • 차등 표현식 테이블, 히트맵, 카운트, PCA/PCOA 등과 같은 다운스트림 출력 생성 • 내보내기 고해상도 그래픽 및 원시 또는 필터링 된 테이블 • QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis로 결과 내보내기 • RNA-seq/scRNA-seq/microarray 데이터용으로 사용하기 쉬운 파이프라인 배포 • 공개 데이터(GEO, TCGA 등) 다운로드 또는 비교 옵션을 구현합니다. 일시 : 2021년 9월 29일 오전 3시 참가신청 : 클릭 예정된 교육 IPA 신규 사용자 2부 교육 : QIAGEN IPA를 사용한 대규모 데이터 세트 분석 및 지식 기반 쿼리 • 데이터 세트(RNA-seq, scRNA-seq, proteomics, metabolomics 등)를 업로드하고 IPA에서 대화형 코어/경로 분석 수행 • 생성된 다양한 결과 유형 이해(경로, 주요 조절자, 생물학적 기능/질병에 대한 영향 등) • 다양한 실험 조건(치료, 시점, 단일 세포 클러스터, 질병 유형 등)을 비교하고 유사점 및 대조 식별 • 가설 생성을 위한 데이터 세트 또는 실험 설계 없이도 네트워크 생성 일시 : 9월 8일 오전 3시, 9월 21일 오후 9시 참가신청 : 클릭 IPA 심화 교육: QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis(IPA): 심층 교육 내용 • 1부 : QIAGEN IPA 코어 및 비교 분석에 대한 심층 분석 • 2부 : 사용자 데이터 없이도 QIAGEN IPA를 사용하는 방법 자세히 알아보기 일시 : 9월 22일 오후 9시 참가신청 : 클릭 Single-Cell training: QIAGEN CLC Genomics Workbench를 사용한 RNA-seq 및 Single Cell RNA-seq 데이터 분석 내용 RNA-seq 및 scRNA-seq 데이터의 경우 사용자는 다음 방법을 배웁니다. • fastq 파일, 세포 매트릭스 파일 및 메타데이터 가져오기 및 참조 다운로드 방법 • 읽기를 참조 게놈에 매핑하고 매핑된 %, knee plots 등을 표시하는 유전자 및 전사체 수 및 QC 보고서 생성 • 히트맵, 차등 발현 테이블, PCA/PCOA 플롯, t-SNE 플롯, UMAP 플롯, 도트 플롯, 벤 다이어그램 등과 같은 결과의 시각화 생성 • Annotate single-cell clusters overlain with gene expression • RNA-seq 및 scRNA-seq 워크플로우를 쉽게 커스터마이징 • 출판 품질의 그래픽, 표 및 보고서 내보내기 • QIAGEN CLC Genomics Workbench에서 직접 차등 발현 테이블을 QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis로 전송 일시 : 2021년 9월 23일 오전 3시 참가신청 : 클릭 신규 고객 성공 사례: 분자 경로를 사용하여 종양의 아킬레스건을 표적으로 오클랜드 대학의 의학 연구원인 Dr. Cristin Print가 어떻게 분자 경로가 파괴되어 암 및 기타 질병을 유발하는지 이해하기 위해 노력하는 방법을 알아보고 고급 경로 분석이 그와 그의 팀이 암 및 질병 연구에 대한 통찰력을 얻는 방법을 어떻게 변화시켰는지에 대한 그의 이야기를 탐구해보세요. Clinical Insights HGMD 웹 세미나 : HGMD Professional을 사용하여 변이 지식을 극대화하세요. 내용 - HGMD Professional의 힘을 발견하고 전 세계 실험실에서 임상 테스트 해석에 HGMD Professional을 사용하는 이유를 확인 - 온라인 인터페이스 및 다운로드 가능한 HGMD 데이터베이스 사용 방법 알아보기 일시 : 2021년 9월 9일 오후 8시 참여신청 : 클릭 HSMD 웨비나: 변이에 주석을 달고 유병률을 평가하기 위해 실제 종양 사례 및 QIAGEN 지식에서 얻은 인사이트 활용: 새로운 체세포 데이터베이스 도입 내용 - HSMD에 힘을 실어주는 콘텐츠 소스 - 연구, 분자 테스트 및 의약품 개발을 포함한 여러 응용 분야에 HSMD를 사용하고 적용하는 방법과 어떤 상황에서 HSMD에 액세스할 수 있는지 탐색 일시 : 2021년 9월 29일 오후 12시 참여신청 : 클릭 QCI 웨비나: NGS 2차 분석 워크플로를 5단계로 단순화하는 방법 - QCI 2차 분석에서 NGS 분석 파이프라인을 생성, 수정, 검증 및 실행하는 방법을 알아봅니다.> - 간단한 5단계로 전체 시퀀싱 실행을 분석하는 방법에 대한 가상 데모 - QCI Secondary Analysis가 규정 준수 관리를 단순화하고 값비싼 하드웨어, 추가 IT 리소스 및 고급 생물정보학 기술의 필요성을 최소화하는 방법 보러가기 HGMD® Professional의 2021.2 릴리스를 발표합니다. 이제 HGMD Professional의 여름 릴리스를 사용할 수 있습니다. 323,661개 이상의 전문가가 선별한 질병 유발 돌연변이를 포함하는 HGMD는 생식계열 돌연변이의 가장 크고 가장 신뢰할 수 있는 출처로 남아 있습니다. 이 새 릴리스에는 이전 릴리스보다 8,954개 더 많은 돌연변이 항목이 있습니다. 신경 장애에 대한 새로운 HGMD 애플리케이션 노트 보러가기 새로운 COSMIC 솔루션 개요 보러가기 새로운 QCI 해석 빠른 시작 안내서 보러가기

[뉴스레터] QIAGEN IPA User Group Meeting 조회 644 2021. 05. 13 - Transform proteomic data into pristine results 연구자들이 MS 및 SWATH 데이터에서 새로운 발견을 놓치지 않도록 보장하는 방법을 찾을 수 있습니다. 프로테오믹 데이터 분석 및 해석을 위한 bioinformatics 솔루션에 대한 제품 업데이트 및 교육 뿐만 아니라 전문가와의 Q & A 세션을 제공하는 2시간짜리 온라인 이벤트에 참여하세요. Why attend? QIAGEN IPA에서 기능 훈련 세션을 통해 흥미로운 새로운 기능과 데이터를 사용하는 방법을 배울 수 있습니다. QIAGEN 전문가가 답변하는 기술, 과학 및 지원에 대한 질의응답을 할 수 있습니다. 현재 QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis(IPA)를 사용하고 있든 없든, 이 회의는 여러분의 실험에서 이전보다 더 깊은 통찰력을 얻을 수 있는지에 대해 생각하도록 하는 것을 목표로 합니다. 진행 날짜 : 2021년 5월 26일 오후 2시 등록하기 : 링크

What’s new in the QIAGEN IPA Spring 2021 Release 조회 898 2021. 04. 16 - 90,000개 이상의 Analysis Match 데이터세트 컬렉션에서 관련 분석을 쉽게 찾을 수 있습니다. 이제는 필터링 및 사용자 지정 가능한 메타데이터 열을 사용하여 보거나 오버레이 할 분석 및 데이터세트를 검색하는 것이 훨씬 쉽고 정확합니다. 프로젝트 검색에서 관심있는 키워드를 단순히 입력하신 후, 메타데이터 열 위의 필터를 사용하여 원하는 대로 결과를 좁히실 수 있습니다. Figure 1. 데이터 검색 및 분석에는 검색 및 필터링을 위한 새로운 옵션이 있습니다. 예시는 NASH의 마우스 간의 연구를 찾기 위한 검색을 보여줍니다. 강화된 세포 내 위치 찾기를 통해 생물학을 설명하세요. 단백질의 세포 내 위치는 세포에서 기능과 역할에 대한 단서를 제공할 수 있습니다. 예를 들어, 미토콘드리아에서 발견되는 단백질은 라이소좀에서 발견되는 것과는 다른 역할을 합니다. 이제 모든 네트워크 또는 경로에서 분자의 상세한 세포 내 위치를 자동으로 발견하고 주석을 달 수 있습니다. Figure 2. 세포 내 위치 정보를 표시하도록 구성된 경로 Figure 3. Figure 2의 경루에서 골지체에 국한된 단백질을 보여주는 세부 사항. 다른 애플리케이션 개선 사항 Genes and chemicals에 대한 자동 완성 기능이 개선되었습니다. Gene Views, Chem Views, Canonical Pathway Reports 등이 새로운 모양과 느낌으로 업데이트 되었습니다. Figure 4. Gene View의 새로운 모습 콘텐츠 업데이트 새로운 QIAGEN OmicSoft Single Cell Land 및 SARS-CoV-2 데이터세트는 현재 Analysis Match에서 사용할 수 있는 90,000개 이상의 데이터세트에 포함되어 있습니다. 새로운 2개의 Canonical Signaling Pathways 확장성 심근병증 신호 전달 경로 (Dilated Cardiomyopathy Signaling Pathway) NAD 신호 전달 경로(NAD Signaling Pathway) 4개의 기존 Canonical Signaling Pathways에 활동 패턴 추가 자가포식(Autophagy) T 세포 수용체 신호(T Cell Receptor Signaling) 활성 및 무반응 T 림프구에서 IL-2 발현의 조절(Regulation of IL-2 Expression in Activated and Anergic T Lymphocytes) 수지상세포 성숙(Dendritic Cell Maturation) 업데이트된 1개의 Canonical Signaling Pathway 코로나바이러스 발병기전 경로(Coronavirus Pathogenesis Pathway) 다음을 포함한 12만 개 이상의 새로운 발견 (IPA에서 총 780만 개 이상) >37,000 expert findings >39,000 protein-protein interaction findings from BioGRID >22,100 cancer mutation findings from ClinVar >12,700 findings from the Mouse Genome Database (MGD) >5600 findings from the Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) >2200 Gene Ontology findings >3600 drug-to-disease findings from ClinicalTrials.gov >3900 target-to-disease findings from ClinicalTrials.gov 273 newly mappable chemicals Figure 5. ‘Analysis Match’와 ‘Activity Plot’에서 사용할 수 있는 OmicSoft 분석 콘텐츠. QIAGEN IPA의 최신 개선사항을 더 확인하고 싶으시면 링크를 클릭하세요.

[릴리즈] What’s new in the QIAGEN IPA winter 2020 Release 조회 895 2020. 12. 15 - Work faster and better with the Winter IPA Release 이 릴리스는 몇 가지 IPA 기능을 간소화하여 고객 요청 및 FAS 개선 사항을 처리하도록 설계되었습니다. Improved overlay and access to networks IPA의 중요한 기능은 네트워크 또는 경로에서 여러 ‘omics datasets를 오버레이하고 시각화하는 것입니다. 이제 사용자들은 "Matching molecules"표에서 한 번에 더 많은 행을 볼 수 있으며 네트워크 또는 pathway에서 노드 막대 차트를 더 쉽게 표시할 수 있습니다. 그리고 마침내 microRNA 타겟 필터는 마우스 클릭 한 번으로 microRNA-mRNA 네트워크를 시각화하는 "Display as Network" 버튼을 포함합니다. Enhanced search & filtering of Analysis Match analyses with added metadata 이제 OmicSoft 데이터 세트 및 분석에서 PubMed ID 및 Therapeutic Area fields를 추가하여 관련 분석을 찾고 필터링하는 더 많은 방법이 있습니다. 아래 이미지는 Analysis Match 분석 중 특정 PMID를 검색하는 것을 보여줍니다. Three new Canonical Pathways Ferroptosis Signaling Pathway Role of MAPK Signaling in Inhibiting the Pathogenesis of Influenza Role of MAPK Signaling in Promoting the Pathogenesis of Influenza Addition of activity patterns to three existing Canonical Pathways HER-2 Signaling in Breast Cancer IL-17 Signaling Role of Hypercytokinemia/hyperchemokinemia in the Pathogenesis of Influenza >104,000 new findings (bringing the total in IPA to over 7.7 million), including: ~24,000 Expert findings ~44,000 cancer mutation findings from ClinVar ~18,000 protein-protein interaction findings from BioGRID ~2,300 Gene Ontology findings ~750 drug-to-disease findings from ClinicalTrials.gov ~600 target-to-disease findings from ClinicalTrials.gov ~31,000 protein-protein interaction findings from IntAct ~500 newly mappable chemicals >6,900 new datasets for a total of >80,000 in Analysis Match and Activity Plot 이러한 분석은 2020년 12월 14일 부터 제공됩니다. Improved experience for new and trial users with training material link on Quick Start 아래 빨간색 상자에서 강조 표시된 링크를 통해 유용한 새 리소스로 접근할 수 있습니다. 자세한 사항은 해당 페이지를 참고해 주세요.

[뉴스레터] 10월 QDI Newsletter 조회 1171 2020. 10. 05 - 이달의 특징 - QIAGEN IPA 가을 Release 최신 QIAGEN IPA 릴리스가 이번 달에 제공됩니다. 이 릴리스는 현대적인 모양과 느낌, 내장된 짧은 개요 비디오 및 학습자료에 대한 액세스와 함께 새로운 빠른 시작 가이드로 IPA를 업데이트합니다. 기타 개선 사항 및 업데이트에는 상위 핵심 분석 결과에 대한 새로운 그래픽 요약, My Pathways 및 새로운 콘텐츠 업데이트 (코로나 바이러스 복제 경로, 종양 미세 환경 및 총 73,000개 이상의 분석을 위한 7700개 이상의 새로운 Analysis Match datasets을 포함한 6 개의 새로운 경로)가 포함됩니다. 곧 출시될 릴리스의 스크린샷 보러 가기 Click! 다른 모든 개선 사항에 대한 자세한 정보 확인하러 가기 Click! - QCI Interpret Translational 출시 QCI Interpret Translational은 10월 말에 출시됩니다. QCI Interpret Translational은 신속한 증거 기반 변형 우선순위 지정 및 필터링을 지원하는 강력한 변형 분석 소프트웨어입니다. QCI IT는 영향력이 입증된 알고리즘, 출판된 문헌의 증거 및 실험실 소유의 데이터베이스를 활용하여 유전 질환 및 특성의 근본적인 원인이 되는 변종을 빠르고 확실하게 분리할 수 있도록 지원합니다. QCI IT 체크아웃에 대한 미리보기를 자세히 알아보려면 여기를 클릭하십시오. 기존 IVA 사용에서 QCI IT로 전환을 생각하는 분들을 위한 Preview 시청하기 - 다가오는 온라인 컨퍼런스 Oncology and hereditary disease User Group Meeting 2020 2020. 10. 07 수요일 오후 8시 - Day 1 – Somatic cancer 2020. 10. 08 목요일 오후 8시 - Day 2 – Hereditary cancer and germline disorders QIAGEN CLC User Group Meeting 2020. 10. 22 목요일 오후 11시 - featuring product updates, training and Q&A sessions, as well as use case presentations from academic and industry experts. 최신 QIAGEN IPA-OmicSoft 사용자 그룹 회의에서 발표자 토크 보러 가기 새로운 인포그래픽 : 바이오 마커 및 표적 발견, 미생물-유전체학 인포 그래픽 새로운 브로슈어 : QIAGEN Discovery Bioinformatics Services - 지난 웨비나 - 초보자를 위한 IPA 가상 워크샵 Introduction to IPA Learning about Genes/Disease and Network Construction (for those of you with no datasets) Uploading ‘Omics Datasets New User Tips and Tricks - IPA를 이용한 RNAseq, Microarray, Proteomics 및 Metabolomics 데이터 세트의 활용 Core Analysis: Pathways, Regulators, Functional Impact and More! Comparing your Datasets Open Forum for advanced questions 최신 연구에서 사용되는 QDI 제품을 보여주는 LinkedIn 게시물 보러가기 - Remdesivir에 대한 QIAGEN CLC Main Workbench 사용 사례 - QIAGEN ArraySuite 및 OmicSoft Lands 팁과 요령 비디오 - COVID19 연구를위한 QIAGEN CLC Genomics Workbench 사용 사례