GeneCodes Corp. Sequencher August 2013 Newsletter

 

 

Sequencher is Used Globally for DNA Studies of Malaria and Mosquitos

 

모기에 물려 전염되는 기생병인 말라리아는 모기가 물었을 때, 혈액과 감각이 없는 animal senses로 효소들이 삽입되어 모기가 소화를 잘 할 수 있도록 도와줍니다. 이러한 효소들이 삽입되는 동안, malaria parasite가 모기의 혈액에서 새로운 host로 전달되어 사람간의 질병이 퍼지도록 만듭니다. International Medical Corps에 따르면, 말라리아로 인해 사망한 경우의 90%가 아프리카에서 일어나고 있으며 전 세계 인구의 절반에 다다르는 3.3백만의 인구가 말라리아에 전염될 위기에 처해있습니다. 이러한 통계 수치를 통해 예방과 치료 기술의 연구가 전 세계적으로 필요한 상황이며, 강력한 도구를 이용한 연구를 통해 시간이 절약될 수 있도록 하는 것이 중요합니다.

 

Spain 의 Seville에 있는 과학자인 Josué Martínez-de la Puente와 Santiago Ruiz는 최근에 말라리아에 전염되는 과정을 알아내기 위해서는 모기의 종을 판별하는 것이 중요하다는 연구를 발표하였습니다. 그들은 DNA sequencing과 amplification을 통해 종의 판별을 위한 모기 혈분이 소화되는 과정과 DNA extraction 과정을 연구하였습니다. 모기 종의 sequence를 분석하고 GenBank sequences와 비교하는 분석들이 Sequencher DNA Analysis Software를 이용하여 진행되었습니다. Sequencher's tool을 통해, 이러한 과학자들이 host species identification을 성공적으로 찾아내는 것이 가능했습니다.

 

Walter Reed Army Institute of Research의 Desmond Foley and Genelle Harrison는 모기의 침샘과 말라리아에 대하여 연구를 하였습니다. 이러한 연구자들은 PCR을 광학 현미경법 기술을 대신 이용하여 말라리아의 종충 비율(sporozoite rates)의 확인을 위한 새로운 방법을 만들었습니다. 광학 현미경법 기술은 말라리아에 대하여 false positive를 제공하는 것으로 생각되어 이를 PCR을 이용하여 제거하는 방법으로 시도하였습니다. 이러한 새로운 방법을 통해, 과학자들은 Sequencher를 이용하여 정확한 종 확인을 위해 알려진 BLAST sequence와 비교하여 align을 진행하였습니다.

 

 

Videos


> Installation of NGS tools