CLC bio사에서는 아래와 같은 내용으로 6월 월간뉴스를 발표하였습니다.
더 자세한 내용은 링크된 주소를 참고하세요.
[News]
New release of Molegro Virtual Docker 6.0
새로운 버전의 Molegro Virtual Docker가 릴리즈 되면서 다양한 기능이 추가되었습니다. 그 중에서도 Molegro Data Modeling package에서만 제공하던 데이터모델링(Data modeling)기능이 추가되어 이제부터는 Molegro Virtual Docker를 통해서 바로 사용이 가능합니다.
• New and powerful regression features : Support Vector Machine regression과 Partial Least Squares
• K-Nearest Neighbors 또는 Support Vector Machine을 이용한 분류
• Regression의 튜닝과 model parameters 분류의 자동화
• 고해상도 데이터의 visualization을 위한 Spring-Mass Maps
• Data sets의 클러스터링
• Principal Component Analysis
• Outlier Detection
> More about Molegro Virtual Docker
Binding focus to the field of cancer research
매년 전 세계적으로 수 백만명이 암으로 목숨을 잃어가고 있는 상황이며, WHO에서는 2008년에 7.6백만 명이 암으로 목숨을 잃었으며 향후 2030년에는 이 수치가 13.1백만 명 이상이 될 것이라고 예상하였습니다.
이에 따라, 암 연구에 대한 중요성이 대두되고 있으며 CLC bio사는 전 세계의 연구자와 임상의들이 암 연구에 도움을 제공하기 위해 clccancer.com 이라는 웹사이트를 오픈하였습니다. 이 웹사이트를 통하여 application notes, scientific papers, information about research project를 제공하고 있습니다.
> More info about clccancer.com
Building the Scarlet Macaw draft genome
CLC bio사를 포함한 연구자팀은 Avian(새) genom연구를 통하여 높은 퀄리티의 de novo genome assembly가 low conts 값에서도 만들어 질 수 있음을 증명하였습니다. Whole genome 분석을 통하여 앵무새의 지능, 말하기 능력, 장수 등과 같은 습성에 대한 후보 유전자를 발굴해 내었습니다.
[Science]
A Multi-Platform Draft de novo Genome Assembly and Comparative Analysis for the Scarlet Macaw(Ara macao)
Seabury CM, Dowd SE, Seabury PM, Raudsepp T, Brightsmith DJ, et al.
PLoS ONE 8(5): e62415. doi:10.1371 (2013)
A whole genome shot-gun project는 새롭고 큰 Scarlet Macaw(금강앵무)의 draft de novo genome assembly가 가능하도록 하였습니다. 연구는 Scarlet Macaw의 말하기, 지능, 장수와 같은 생물학적 습성에 대한 관심으로 시작하였습니다.
CLC Genomics Workbench는 위의 연구를 수행함에 있어 quality trimming과 de novo hybrid assembly를 진행하는데 사용되었습니다.
[Tutorial]
Features of Molegro Virtual Docker 6.0
새롭고 강력한 데이터모델링 기능이 탑재된 Virtual Docker를 사용하는 방법을 비디오를 통해 만나보세요.
> Watch the introductory video
Did you know?
CLC Genomics Workbench에는 무료로 제공하는 plugin도 다양하게 준비되어 있습니다.