Elsevier R&D Solutions
2016년 8월 Pathway Studio 뉴스레터 소식
- Thought Leader MD Anderson의 Phil Lorenzi 박사가 Apoptosis Pathway Census를 발표합니다.
- Hot Topic Illumina와 파트너쉽을 맺으면서 연결된 분자와 상호작용을 더 자세히 살펴볼 수 있게 되었습니다.
- The Hive Hive에 대해서 들어보신 적이 있으신가요? 저희의 공동 연구자를 소개합니다.
올해 6월에 열린 NIH Bioinformatics Symposium에서 MD Anderson의 Phil Lorenzi 박사는 Pathway Studio를 이용하여 거의 완벽한 카탈로그를 게재하는 방법에 대해 논의하였습니다.
Phil Lorenzi 박사는 autophagy와 연관된 entities와 relationships을 완벽하게 목록화하였고, Autophagy pathway를 밝히기 위해 발전된 census 모델 방법론을 이용하면서 이 모델이 apoptosis pathway 를 설명하는데 얼마나 적절한지 설명했습니다.
그의 발견은 새로운 apoptosis 결과가 일반적인 결론들 즉,
(1) siRNA screening은 매우 큰 false negative rate을 가지고 있음 (그만큼 진짜 ‘hits’을 못 찾는다는 것을 의미)
(2) 가장 포괄적인 pathway 범주를 제공하는 Pathway Studio를 활용한 텍스트-마이닝 기반의 pathway 분석을 지지합니다.
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Hot Topic 2
Illumina와 파트너쉽을 맺으면서 연결된 분자와 상호작용을 더 자세히 살펴볼 수 있게 되었습니다.
Illumina Correlation Engine (CE) 플랫폼 사용자들은 연구 결과를 바로 Pathway Viewer나 Pathway Studio로 보내 해당 유전자에 대해 심도 있는 biological context를 얻을 수 있습니다.
Pathway Viewer를 통해 사용자들이 찾은 유전자들이 생물학적으로 연결되어있는지 볼 수 있고, 유전자에서 가장 잘 알려진 5개의 pathway 역시 보실 수 있습니다. Pathway Studio 사용자는 이 탭을 클릭하면, application이 열릴 때 바로 gene list를 뽑을 수 있습니다. 연구자들은 Pathway Studio를 이용하여 full network building과 functional annotation 툴을 이용할 수 있으며, 관심 유전자에 대해 더 심도 있는 생물학적 정보를 얻을 수 있습니다.
Pathway Studio free trial은 Pathway Viewer나 Pathway Studio 탭에서 신청하실 수 있습니다.
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Hot Topic 3
Hive에 대해서 들어보셨나요?
Hive는 초기단계의 약물을 개발하는 엄선된 생물공학 그룹과 약학 기업들과의 Elsevier R&D Solutions의 Collaboration입니다.
Elsevier는 1년 동안 Pathway Studio를 포함한 R&D Solutions을 사용하는 Hive 참여자들을 관찰할 것 입니다. Hive는 주목받는 혁신 사업을 돕고 그들의 혁신을 촉진하기 위해 플랫폼을 제공하는 것 뿐만 아니라, 다른 것으로부터 더 배우고 산업에서 협동 관계의 파워를 보여주기 위해 넓은 커뮤니티를 위한 촉매제 역할을 할 것 입니다. Elsevier는 이런 일을 함으로써 그들의 스토리를 만들고 알릴 것입니다, 참여 회사에 대해 잘 나와있는 사이트를 통해 Elsevier R&D Solutions로써의 역할을 할 것입니다.
아래 링크를 클릭하셔서 Hive 스토리를 들어보세요.