CLCbio사에서는 아래와 같은 내용으로 12월 월간뉴스를 발표하였습니다.
더 자세한 내용은 링크된 주소를 참고하세요.
News
Bata release of Genomics Workbench 7.0
CLC Genomics Workbench의 새로운 베타버전이 릴리즈 되었으며, 2014년 2월에 정식 버전이 발표될 예정입니다.
CLCbio사는 CLC Genomics Workbench를 보다 편리하게 사용할 수 있도록 개발하는데에 포커싱하고 있습니다. 이번에는 무엇보다도 새로운 GUI, RNA-Seq analysis tool, expression 분석의 새로운 statistical tool 업그레이드가 있습니다.
Evaluation of de novo transcription assemblies
Sequence Comparative Analysis using Networks(SCAN)는 NGS 데이터의 de novo transcript assemblies를 평가하기 위해 개발된 소프트웨어입니다.
Sequence Comparative Analysis using Networks(SCAN)는 networks에서 distinct node sets을 비교하도록 디자인 되었습니다.
SCAN은 Velvet, ABySS, CLC를 이용하여 transcriptomes를 assembly한 것에 대하여 테스트를 수행하였습니다.
MUS - Maintenance, Upgrade and Support
CLCbio 프로그램의 MUS(Maintenance, Upgrade, Support)에 대한 소개 및 내용들이 상세하게 설명되어 있습니다.
Time-saving XSQ support
Prof. Robert Donnelly와 그의 팀원들은 large-scale sequencing을 함에 있어 발생하는 병목현상의 문제점을 극복하였습니다.
SOLiD XSQ 파일을 바로 CLC Genomics Workbench에 import 하여, 시간을 절약할 수 있었습니다.
Join our seminar at PAG
1월 14일, PAG에서 열리는 세미나에 참석하셔서 연구관련 정보들을 공유하세요.
세미나에서는 whole eukaryotic genomes, European Ash Tree의 genome sequencing 등에 관한 내용들을 다룰 예정입니다.
Science
Separating homoeogs by phasing in the tetraploid wheat transcriptome
Genome Biology 2013, 14:R66 doi:10.1186/gb-2013-14-6-r66 Krasileva et al.
Transcriptome assembly를 최적화하고 merge된 homoeologs를 분리하기 위해 생물정보학에 특화된 workflow를 개발하였습니다. CLC Genomics Workbench의 de novo assembly 알고리즘을 이용하여 전략을 평가하였습니다.
이러한 연구들로부터 나온 예측은 wheat research community와 comparative genomic studies를 위한 가치 있는 tool을 제공합니다.
Tutorial
Beta release of Genomics Workbench 7.0
개발팀의 Søren Mønsted가 새롭게 릴리즈 된 CLC Genomics Workbench 7.0의 베타버전에 관한 간략한 소개를 담은 동영상입니다.
Did you know?
CLCbio사가 참여한 Sequencing ecosystem에 관한 흥미로운 기사를 읽어보세요
Scientific papers
많은 연구자들이 연구를 수행함에 있어 CLCbio사 제품을 이용하고 있습니다.
CLCbio사 제품을 인용한 논문들을 확인해보세요.
Last improvements
2014년 2월에 공식 발표 예정인 새로운 베타버전이 릴리즈 되었습니다.
New release
> CLC Software Developer Kit 7.0