CLCbio사에서는 아래와 같은 내용으로 5월 월간뉴스를 발표하였습니다.
더 자세한 내용은 링크된 주소를 참고하세요.
News
Successful cancer software launch at AACR
지난 4월 8일, cancer에 포커싱된 CLC Cancer Research Workbench가 AACR(American Association for Cancer Research)에서 성공적으로 출시 되었습니다.
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RNA-seq compared to whole exome sequencing
CLC Cancer Research Workbench를 통해 transcriptome과 whole exome sequencing의 variant calling을 비교할 수 있습니다.
Workbench는 mapping, variant calling, filtering, annotation을 위한 알고리즘이 포함된 유용한 workflow를 제공합니다.
Science
Comparison of three next-generation sequencing platforms for metagenomic sequencing and identification of pathogens in blood
BMC Genomics 2014, 15:96 doi:10.1186/1471-2164-15-96 Frey et al.
최근 병원균을 동정할 수 있는 능력을 가진 세 가지 sequencer를 비교하는 연구가 진행되었습니다.
Reche 454 Titanium, MiSeq, Ion Torrent platforms 모두 병원균을 탐지할 수 있지만 read length, depth, speed 면에서는 서로 다른 결과를 보여주었습니다.
이 연구에서 CLC Genomics Workbench가 read mapping을 위해 사용되었습니다.
Tutorial
Join Contigs in CLC Microbial Genome Finishing Module
Join Contigs tool에서 long reads scaffolding option에 대한 튜토리얼입니다.