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유전자 전사조절 메커니즘 연구의 Gold standard 솔루션
TRANSFAC
Transcription factor는 특정 자극에 대한 반응, 질병에 대한 약물 반응 등과 같은 각종 세포 내 과정을 분석하고 확인하는 데 중요한 요소로 생물학 관련 연구 진행을 위한 필수적인 정보입니다.
TRANSFAC은 유전자 전사 조절에 관련된 다양한 정보를 포함하고 있는 데이터베이스로 human, mouse, rat 등 9종에 대한 정보를 제공합니다.
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- Interlinked reports
- Enhancer reports
- Site reports
- Transcription factor reports
- Transcription factor–site interactions
- TFBS ChIP-seq reports
- Positional weight matrices (PWMs)
- Promoter reports
- Transcription factor binding sites
- Pathway visualization tool
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주요 기능 소개
TRANSFAC은 유전자 전사 조절에 관련된 다양한 정보를 포함하고 있는 데이터베이스로 human, mouse, rat 등 9종에 대한 정보를 제공합니다.
알려진 진핵생물의 transcription factor, binding site 정보, 이들로 조절되는 유전자 등의 정보들과 각종 레포트, 분석을 제공하는
TRANSFAC으로 생물학 연구에 인사이트를 발견해 보세요.
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진핵생물의 전사 인자 결합 부위 예측
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Report
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MATCH Suite
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Combines promoter & pathway analysis
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적용 사례
TRANSFAC이 연구에서 어떤 역할을 하는지 확인해보세요.
- Wingender, E., Schoeps, T., Haubrock, M., Krull, M., & Dönitz, J. (2018). TFClass: expanding the classification of human transcription factors to their mammalian orthologs. Nucleic acids research, 46(D1), D343-D347.
- Kaplun, A., Krull, M., Lakshman, K., Matys, V., Lewicki, B., & Hogan, J. D. (2016). Establishing and validating regulatory regions. for variant annotation and expression analysis. BMC genomics, 17(2), 219-227.
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