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Public sources의 10만개 이상 데이터 세트와 비교 분석을 통한 생물학적 의미 발견
IPA with Analysis Match
IPA with Analysis Match는 Advanced Analytics 모듈 기능들을 모두 포함하고 있으며, 추가로 10만 개 이상의 데이터 세트를 IPA 분석 context에 배치하여 연구자의 데이터 세트와
비교하고 분석할 수 있습니다. 방대한 문헌 지식과 유전자 발현 컨소시엄 collection을 결합하여 가설을 점검, 증명하고 새로운 생물학적 의미를 발견할 수 있습니다.
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- Biomarker discovery
- Drug mechanism of action and toxicity
- Target identification and validation
- Building interactive models of experimental systems
- User-friendly visualization tools
- Disease mechanisms
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주요 기능 소개
IPA with Analysis Match는 Public 데이터세트와 비교하여 비슷한 발현 패턴의 공개 샘플 자료 검토와 결과 해석,
100,000개 이상의 OmicSoft Land 데이터에서 IPA entity 정보 시각화 및 탐색 등의 기능을 제공합니다.
풍부한 데이터세트를 활용해 연구 가설을 점검하고 증명해 보세요.
인실리코젠만의 교육 콘텐츠도 준비되어 있습니다.
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Analysis match
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Activity plot
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Regulator effects analysis
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적용 사례
IPA with Advanced Match가 연구에서 어떤 역할을 하는지 확인해보세요.
- Huang, W., Zhou, H., Hodgkinson, C., Montero, A., Goldman, D., & Chang, S. L. (2021). Network Meta‐Analysis on the Mechanisms Underlying Alcohol Augmentation of COVID‐19 Pathologies. Alcoholism: Clinical and Experimental Research, 45(4), 675-688.
- Alabed, S., Zhou, H., Sariyer, I. K., & Chang, S. L. (2021). Meta-analysis of methamphetamine modulation on amyloid precursor protein through HMGB1 in Alzheimer’s disease. International Journal of Molecular Sciences, 22(9), 4781.
- Bahado‐Singh, R., Vishweswaraiah, S., Mishra, N. K., Guda, C., &Radhakrishna, U. (2020). Placental DNA methylation changes in detection of tetralogy of Fallot. Ultrasound in Obstetrics &Gynecology, 55(6), 768-775.
- Camacho, R. C., Alabed, S., Zhou, H., & Chang, S. L. (2021). Network meta-analysis on the changes of amyloid precursor protein expression following SARS-CoV-2 infection. Journal of Neuroimmune Pharmacology, 16(4), 756-769.
- Scott, A. T., Weitz, M., Breheny, P. J., Ear, P. H., Darbro, B., Brown, B. J., ... & Howe, J. R. (2020). Gene Expression Signatures Identify Novel Therapeutics for Metastatic Pancreatic Neuroendocrine TumorsNovel Therapies for Pancreatic Neuroendocrine Tumors. Clinical Cancer Research, 26(8), 2011-2021.
- 솔루션을 활용한 약물 표적 발견 암 세포주 분석 케이스 스터디
- 솔루션을 활용한 질병 및 약물 치료 메커니즘 케이스 스터디
- IPA Analysis Match의 특징과 새로운 방법의 결과 탐색
- 실험 데이터의 유/무에 따라 IPA를 활용해 가설과 의미를 만드는 방법
- IPA와 OmicSoft Land DB를 활용한 독성 연구 Case study
- 2020 IPA Lastest improvements 및 Advanced Analytics, Analysis Match 소개
[Article]
[人CoSEMINAR]
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CLC Genomics Workbench Premium 생물정보학 연구를 위한 표준 플랫폼 CLC Genomics Workbench의 모든 기능을 포함하는 확장형 버전 |
생물학적 기능과 pathway, 분자적 네트워크를 시각적으로 표현하는 웹 기반의 솔루션 |
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시스템 요구사항
지원 운영체제 |
Windows 운영체제 Windows XP SP2 이상, Windows 7, Windows 8, Windows 10 인터넷 브라우저 Microsoft Edge 87 이상, Firefox 5 이상, Chrome 10 이상, Safari 5.05 이상 Mac 운영체제 macOS Big Sur, macOS Catalina, macOS Mojave Java(런타임 환경) JRE 1.8.0_xx 이상 |
프로세서 |
64비트 OS 및 Java와 함께 2GHz 이상에서 실행되는 CoreTM i5 프로세서 또는 동급 |
메모리 |
Java용 최소 3GB RAM 여유 공간 |
디스플레이 |
최소 1080 x 800 display 필요 |
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