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필요한 만큼, 가볍게
생물정보 분석 솔루션 렌탈 서비스
incoRENTAL
incoRENTAL 서비스는 생물정보 분석 솔루션을 연구자가 원하는 기간만 단기로 사용하거나
해당 솔루션을 활용한 분석 서비스를 의뢰할 수 있습니다.
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렌탈 제공 서비스
- OmicSoft Land : 질병 바이오마커 후보 발굴을 위한 오믹스 포털 데이터베이스
- IPA Analysis Match(출시 예정) : 질병과 타겟 유전자들의 기전 연구를 위한 네트워크 분석 솔루션
- CLC Genomics Server(출시 예정) : NGS raw 데이터의 고속 분석용 서버 솔루션
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incoRENTAL 서비스는 생물정보 분석 솔루션을 원하는 기간만 단기로 사용하거나 해당 솔루션을 활용한 분석 서비스를 의뢰할 수 있습니다.
전사체 기반의 공개 데이터를 활용한 사전 후보 도출 및 분석 결과 검증과 기전 연구를 위한 OmicSoft Land와 IPA 솔루션 활용,
많은 샘플의 NGS raw 데이터부터 처리가 필요한 경우는 CLC Genomics Server 솔루션 활용이 가능합니다.
OmicSoft Land 주요 기능
OmicSoft LAND는 질병 바이오마커 후보 발굴을 위한 오믹스 포털 데이터베이스로 수천 건의 oncology 연구 데이터와
수백 가지의 disease 연구 데이터, single sell transcript 데이터 세트를 통해 인간, 마우스, 쥐 연구에서 인사이트를 얻을 수 있습니다.
맞춤형 분석 및 시각화 도구를 제공하여 public 게놈 데이터 세트를 탐색하고 omics 데이터 세트에 대한 풍부한 분석을 제공 합니다.
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OncoLand
- 혈액 및 고형암 등에 초점을 맞춘 수천 건의 oncology 연구 데이터
- 맞춤형 visualization 및 analysis tool로 public 게놈 데이터 세트를 탐색
- 맞춤형 Land를 구축하여 수천 개의 데이터 세트와 visualization
- TCGA, BeatAML, ICGC, TARGET, CGCI 등 암 컨소시엄
- CCLE, GSK 및 NCI와 같은 세포주 프로파일링 컬렉션
- 발현, 돌연변이, CNV, 임상 공변량, 생존 곡선 분석
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DiseaseLand
- 암을 제외한 수백 가지 의 disease에 대한 발현 연구
- 맞춤형 visualization 및 analysis tool로 public 게놈 데이터 세트를 탐색
- 맞춤형 Land를 구축하여 수천 개의 데이터 세트와 visualization
- 질병 vs. 정상, 치료 군 vs. 대조군, 내성 vs. 민감성 및 기타 비교
- 인간, 마우스, 쥐 모델 RNA-seq, Microarray, NIH LINCS
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Single cell Land
- 통합된 Single cell transcript 데이터 세트를 탐색하여 특정 암세포 유형 또는 하위 집합에서 고유한 패턴 확인
- 맞춤형 visualization 및 analysis tool로 public 게놈 데이터 세트를 탐색
- 맞춤형 Land를 구축하여 수천 개의 데이터 세트와 visualization
- 개별 세포 간의 유전자 발현 차이 발견
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IPA with Analysis Match 주요 기능
- #Transcriptomics 분석
- #Proteomics 분석
- #Metabolomics 분석
IPA with Analysis Match는 Public 데이터세트와 비교하여 비슷한 발현 패턴의 공개 샘플 자료 검토와 결과 해석,
100,000개 이상의 OmicSoft Land 데이터에서 IPA entity 정보 시각화 및 탐색 등의 기능을 제공합니다.
풍부한 데이터세트를 활용해 연구 가설을 점검하고 증명해 보세요.
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Analysis Match
- Public 데이터 세트와 비교하며 연구자 데이터셋과 비슷한 발현 패턴의 공개 샘플 자료 검토 및 분석 결과 해석
- 공통되거나 반대로 작용하는 upstream, downstream의 키워드 클러스터링을 통한 검증
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Activity Plot
- 100,000개 이상의 OmicSoft Land 데이터 정보에서 Upstream Regulator, Causal Network, Canonical Pathway, Disease and Function과 같은 IPA entity의 정보를 시각화하고 탐색
- 질병 상태, 치료 조건, Knockouts 등을 나타내는 메타데이터를 포함한 데이터 세트에서 예측된 생물학적 활동을 탐색하여 IPA entity에 대한 통찰력 제공
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Pattern Search
- Network 또는 Pathway에 있는 유전자 collection을 검색하여 OmicSoft Land를 통해 100,000개 이상의 분석 정보를 즉시 스캔
- 유사하거나 다른 유전자 발현 패턴을 가진 다른 컨소시엄 데이터셋 정보(OmicSoft Land) 검색
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CLC Genomics Workbench 주요 기능
CLC Genomics Workbench는 분석 파이프라인과 시각화를 통해 Raw 시퀀싱 파일에서부터
Publication 가능한 결과까지 간편하게 진행 가능하고 QC 보고서도 손쉽게 생성할 수 있습니다.
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Resequencing analysis
- Read mapping
- Variant detection(SNP, Indel, Structure, CNV)
- Variant filtering & annotation
- Biomedical workflows(SARS-CoV-2, QIAseq)
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De novo sequencing
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RNA-Seq and Small RNA analysis
- Reads mapping & Expression profiles
- Differential expression
- Heat map & Venn diagram
- Gene set test
- miRNA analysis
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Epigenomics
- Histone ChIP-Seq
- Transcription Factor ChIP-Seq
- Bisulfate sequencing
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Classical sequence analysis
- Alignments and Trees
- General sequence analysis
- RNA Structure
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Molecular Biology
- Sanger sequencing analysis
- Primers and probes
- Cloning
- Restriction site
- BLAST
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솔루션 렌탈 서비스 참고사항
* 해당 서비스는 활용하고자 하는 솔루션과 사용 기간에 따라 접근 방법과 서비스 정책이 다르기 때문에 상담이 필요합니다.
1) 생물정보 분석 솔루션 렌탈 : 인실리코젠의 서버 플랫폼에 직접 접근하여 사용
2) 케이스 분석 서비스 의뢰 : 비밀보안 서약 후 인실리코젠에서 직접 분석한 결과 제공