IncoTRANSCRIPTOME은 특정 컨디션에서의 유전자 발현 양상을 보는 것에서부터 조직 특이 유전자 분석, house keeping 유전자 분석, 유전자 발현을 이용한 ortholog 분석 그리고 alternative splicing 분석에 이르기까지 다양한 분야에 걸쳐 분석이 가능한 서비스입니다.
여러 조직에서 다양한 발현 양상을 보이는 유전자의 경우 각 조직마다의 발현량은 시퀀싱된 reads 개수를 계산하는 방법으로 Cluster Member Matrix(CMM)을 바탕으로 두 단계의 normalization 과정을 통해 expression value로 환산하는 방법입니다.
DEP를 활용하여 마이크로어레이 분석과 동일하게 다양한 조건에서의 유전자 발현을 분석합니다. Fold change를 이용한 DEG 산출 및 hierarchical clustering, self-organizing maps, K-means clustering, PCA(Principle component analysis) 분석을 통해 의미 있는 발현 패턴들을 정교하게 표현하기도 하고 이들 패턴들 간의 관계를 분석하기도 합니다.
조직 특이 유전자는 특정 조직에서 그 유전자의 세포내 평균 발현량 보다 특이적으로 높게 발현되어 특정 조직의 성격을 결정지을 수 있는 유전자를 선별하는 것을 목적으로 합니다.
서로 다른 종에서 동일한 기능을 수행하는 ortholog 유전자들은 서열 유사성 뿐만 아니라 동일한 발현 패턴으로 조절될 것입니다. 따라서 일정 수준 이상의 서열 유사성을 갖는 유전자들끼리의 발현 패턴을 ortholog 유전자 분석에 이용합니다. 이때 활용되는 발현 패턴은 DEP를 활용하며 동일 패턴 유무는 Pearson's correlation coefficient를 통해 판단합니다.
유전자의 구조 중에서 특히 유전자의 기능에 중요한 영향을 미치는 부분은 유전자의 발현을 조절하는 프로모터 영역입니다. 프로모터를 포함한 유전자의 upstream에 존재하는 전사인자 binding site의 예측을 통해 유전자 네트워크에서의 생물학적인 의미를 찾을 수 있는 기초 데이터를 제공합니다.
(주)인실리코젠에서는 일방적인 분석 서비스의 제공을 지양하고 상호 만족을 위해 고객과의 소통을 우선시합니다. 전화 또는 이메일을 통한 수시 보고 및 직접 방문을 통한 상세 브리핑을 제공하여 고객의 요구사항을 정확히 분석하고 성공적인 결과를 도출하고자 합니다.
분석 과정 및 모든 데이터는 철저한 보안 관리를 통해 보호되며 결과 및 보고서는 최종 보고시 온라인 또는 오프라인으로 고객에게 직접 전달됩니다.