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단순하지만 강력한 DNA 서열 분석 소프트웨어

Sequencher

DNA, RNA 및 단백질 서열 데이터 분석까지

심플한 인터페이스로 Sanger sequencing 데이터뿐만 아니라 NGS, RNA-seq 데이터들까지

쉽고 빠르게 분석할 수 있습니다. 강력하면서도 간단한 분석을 통해 visualization 된 표와 그래프, 리포트 등을 제공합니다.

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  • NGS data analysis
  • RNA-seq
  • Sequencher connections tool
  • Sequence assembly
  • Variance table & Translated variance table
  • Plugins

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** FUNCTION **

주요 기능 소개

Sequencher는 Sanger sequencing 데이터의 분석과 NGS 및 RNA-seq 데이터의 분석을 직관적으로 수행할 수 있습니다.

또한 Connections 기능을 통해 병렬로 여러 분석이 가능합니다.

Sequencher의 다양한 기능을 확인해 보세요.

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Sanger sequencing

  • Sequence editing
  • Sequence trimming
  • Sequence assembly
  • Assemble to reference
  • Multiple-Sequence alignment
  • Restriction mapping
  • Confidence values
  • SNP detection
  • Automated analysis


Next-Generation sequencing

  • FastQC quality control reports
  • RNA-seq
  • De novo assembly
  • Reference-Guided alignment
  • Variant Calling with SAMtools
  • Multiplex ID
  • SNP analysis
  • Methylation studies
  • RNA-Tolerant alignment


Regulator effects analysis

  • Customize your workspace
  • Find amino acids
  • Variance table
  • Translated variance table
  • Reports


Downstream effects analysis

  • BLAST and Local-BLAST
  • Primer-BLAST
  • MUSCLE and trees

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** RESEARCH-Ex **

적용 사례

Sequencher가 연구에서 어떤 역할을 하는지 확인해보세요.

[Article]

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    ** solution **

    찾고 있는 솔루션이 아닌가요?

    다양한 서비스가 준비되어 있습니다.


    CLC Genomics Workbench

    유전체학, 전사체학 및 후성 유전체학 분석 등 NGS 데이터 분석을 더욱 쉽게 작업해보세요.


    OmicSoft Suite

    OmicSoft Land를 이용하려면 Suite가 필요합니다. 표준화된 분석 파이프라인으로 서버 환경에서 데이터 분석을 수행해보세요.


    IPA with Analysis Match

    OmicSoft land DB와 연계된 Analysis Match 모듈을 이용하면 공개된 컨소시엄 정보들과 비교하고 분석하여 바이오마커 발굴에 활용될 수 있습니다.

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    ** system **

    시스템 요구사항

    지원 운영체제

    Windows 운영체제

    Windows 8 이상 (64-bit only)

    프로세서

    64비트 OS 및 Java와 함께 2GHz 이상에서 실행되는 CoreTM i5 프로세서 또는 동급

    메모리

    3GB RAM(* NGS 데이터로 작업하려면 더 많은 메모리가 필요합니다.)

    ** BWA, Cufflinks suite, Velvet : more 8 GB RAM

    ** GSNAP : more 16 GB RAM

    디스플레이

    최소 1080 x 800 display 필요

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