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서열 기반의 분자생물학 데이터 분석을 손쉽게

CLC Main Workbench

염기 서열 분석의 기초 솔루션 CLC Main Workbench는 DNA, RNA 및 Protein 서열 기반의 데이터를 사용자 친화적인 GUI 환경에서 편리하게 분석할 수 있습니다.

Sanger sequencing 데이터 분석, primer design, insilico cloning, alignment 등 다양한 분석을 시작해보세요.

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  • Sanger sequencing data assembly
  • Primer design
  • Alignment & Phylogenic trees
  • Cloning
  • Expression analysis
  • BLAST
  • Database search
  • Workflows
  • 3D protein structure viewer
  • Plugins

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** FUNCTION **

주요 기능 소개

CLC Main Workbench는 DNA, RNA, Protein 및 유전자 발현 등의 최신 분석기법과
효과적인 데이터 관리, 최적화된 그래픽을 제공합니다.

또한 DNA assembly, primer design, SNP 분석, RNA 2차 구조 분석, Multiple alignment 등
다양한 분석과 Plug-In 모듈 등을 통해 맞춤형 분석이 가능합니다.

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Sanger sequencing analysis

  • Trim sequences
  • Assemble sequences
  • Secondary peak calling
  • Extract consensus sequences


Cloning & Restriction sites

  • Cloning
  • Restriction site analysis
  • Create enzyme list
  • Gateway cloning


Primer design

  • Design primers
  • Find binding sites
  • Create fragments
  • Analyze primer properties


Expression analysis

  • Transformation & Normalization
  • MA / Scatter plot
  • Quality control – Box plot
  • Gene set enrichment analysis


Alignment & Trees

  • Alignment
  • Phylogenetic trees
  • Pairwise comparison
  • Additional algorithm


BLAST & Database download

  • NCBI BLAST & Local BLAST
  • Create BLAST databases
  • Manage BLAST databases
  • Data download

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** RESEARCH-Ex **

적용 사례

CLC Main Workbench가 연구에서 어떤 역할을 하는지 확인해보세요.

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** solution **

찾고 있는 솔루션이 아닌가요?

다양한 서비스가 준비되어 있습니다.


CLC Genomics Workbench

유전체학, 전사체학 및 후성 유전체학 분석 등 NGS 데이터 분석을 더욱 쉽게 작업해보세요.


CLC Genomics Workbench Premium

생물정보학 연구를 위한 표준 플랫폼 CLC Genomics Workbench의 모든 기능을 포함하는 확장형 버전


IPA with Advanced Analytics

생물학적 기능과 pathway, 분자적 네트워크를 시각적으로 표현하는 웹 기반의 솔루션

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시스템 요구사항

지원 운영체제

Windows

Windows 7, Windows 8, Windows 10, Windows 11, Windows Server 2012, Windows Server 2016 and Windows Server 2019

Mac

OS X 10.10, 10.11 및 macOS 10.12 ~ 12.0.1. Apple M1 칩이 탑재된 Mac이 지원됩니다.
(최신 macOS 릴리스에서 문제없이 실행될 것으로 예상되지만 이를 보장하지는 않습니다.)

Linux

RHEL 7 이상, SUSE Linux Enterprise Server 12 이상
(최신 Linux 시스템에서문제없이 실행될 것으로 예상되지만 이를 보장하지는 않습니다. BLAST 관련 기능을 사용하려면 libnsl.so.1이 필요합니다.)

프로세서

Intel 또는 AMD CPU

메모리

2GB RAM 필요 / 4GB RAM 권장

저장공간

Reference data 최소 90GB 이상 필요
tmp 디렉토리 최소 100GB 이상 필요

디스플레이

1024 x 768 display 필요, 1600 x 1200 display 권장

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* 연구 대상의 genome size와 복잡성, NGS reads 수 등에 따라 더 많은 메모리가 필요할 수 있음.