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** MAIN **
서열 기반의 분자생물학 데이터 분석을 손쉽게
CLC Main Workbench
염기 서열 분석의 기초 솔루션 CLC Main Workbench는 DNA, RNA 및 Protein 서열
기반의 데이터를 사용자 친화적인 GUI 환경에서 편리하게 분석할 수 있습니다.
Sanger sequencing 데이터 분석, primer design, insilico cloning, alignment
등 다양한 분석을 시작해보세요.
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** ADV **
- Sanger sequencing data assembly
- Primer design
- Alignment & Phylogenic trees
- Cloning
- Expression analysis
- BLAST
- Database search
- Workflows
- 3D protein structure viewer
- Plugins
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** FUNCTION **
주요 기능 소개
CLC Main Workbench는 DNA, RNA, Protein 및 유전자 발현 등의 최신 분석기법과
효과적인 데이터 관리, 최적화된 그래픽을 제공합니다.
또한 DNA assembly, primer design, SNP 분석, RNA 2차 구조 분석, Multiple alignment 등
다양한 분석과 Plug-In 모듈 등을 통해 맞춤형 분석이 가능합니다.
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** FUNCTION IMG TABLE **
Sanger sequencing analysis
- Trim sequences
- Assemble sequences
- Secondary peak calling
- Extract consensus sequences
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Cloning & Restriction sites
- Cloning
- Restriction site analysis
- Create enzyme list
- Gateway cloning
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Primer design
- Design primers
- Find binding sites
- Create fragments
- Analyze primer properties
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Expression analysis
- Transformation & Normalization
- MA / Scatter plot
- Quality control – Box plot
- Gene set enrichment analysis
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Alignment & Trees
- Alignment
- Phylogenetic trees
- Pairwise comparison
- Additional algorithm
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BLAST & Database download
- NCBI BLAST & Local BLAST
- Create BLAST databases
- Manage BLAST databases
- Data download
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** FUNCTION END **
** RESEARCH-Ex **
적용 사례
CLC Main Workbench가 연구에서 어떤 역할을 하는지 확인해보세요.
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** solution **
찾고 있는 솔루션이 아닌가요?
다양한 서비스가 준비되어 있습니다.
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** system **
시스템 요구사항
지원 운영체제 |
Windows
Windows 7, Windows 8, Windows 10, Windows 11, Windows Server
2012, Windows Server 2016 and Windows Server 2019
Mac
OS X 10.10, 10.11 및 macOS 10.12 ~ 12.0.1. Apple M1 칩이 탑재된
Mac이 지원됩니다.
(최신 macOS 릴리스에서 문제없이 실행될 것으로 예상되지만 이를
보장하지는 않습니다.)
Linux
RHEL 7 이상, SUSE Linux Enterprise Server 12 이상
(최신 Linux 시스템에서문제없이 실행될 것으로 예상되지만 이를
보장하지는 않습니다. BLAST 관련 기능을 사용하려면 libnsl.so.1이
필요합니다.)
|
프로세서 |
Intel 또는 AMD CPU |
메모리 |
2GB RAM 필요 / 4GB RAM 권장 |
저장공간 |
Reference data 최소 90GB 이상 필요
tmp 디렉토리 최소 100GB 이상 필요
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디스플레이 |
1024 x 768 display 필요, 1600 x 1200 display 권장 |
** system END **
* 연구 대상의 genome size와 복잡성, NGS reads 수 등에 따라 더 많은 메모리가
필요할 수 있음.