차세대 염기서열 분석법(NGS: Next Generation Sequencing)은 분석 속도와 비용에 있어 생명과학 분야에 새로운 패러다임을 창조해 내고 있습니다. (주)인실리코젠 Codes사업부는 NGS 데이터를 이용한 다양한 분석 전략을 제시함과 동시에 최적의 결과 도출을 위한 컨설팅을 제공합니다.


Inco_Marker2012.jpg

Inco Marker는 종 판별 및 다양한 종류의 마커 발굴 등을 목적으로 한 유전체 서열 내의 마커 개발 분석 서비스입니다.

유전체 전반에 걸쳐 특이적으로 나타나는 서열을 중심으로 primer 또는 probe를 디자인하여 판별이 가능한 마커 개발에 기초 자료를 제공합니다.

분석 방법

InCoMarker_pipeline.jpg

분석 특징 및 내용

{i} SSR, STR, SNP 마커 발굴


1. 반복서열 분석
* Microsatelites 혹은 Simple Sequence Repets (SSRs) 등은 DNA의 polymorphic한 위치에 반복적인 서열로 존재
* 특정 반복 서열 영역을 검색하여 biomarker로 이용 가능한 후보 서열 검출
2. 단일염기변이 분석
* Sequencing 데이터를 이용한 reference 서열과의 비교로 변이 영역 검출
* 단백질 코딩 영역에서의 변이에 따른 단백질 서열 변이 유무 분석

Marker_discovery.jpg

{i} 특이 유전자 발굴을 위한 마커 개발


* 조직 특이적, 생장 단계 특이적 등 다양한 조건에서의 특이 발현 유전자 검출

Specific_gene.jpg

{i} 텍스트 마이닝을 이용한 유용 유전자 발굴


* 텍스트 마이닝 기술을 이용한 문헌 정보로부터 특정 유용 유전자 발굴 및 분자 상호 작용 확인

Textmining.jpg

{i} 마커 특이적 primer, probe 디자인


* 마커 영역이 정확하게 증폭 또는 판별이 되도록 다양한 조건 하에서 디자인
* Species-specific, Genus-specific primer design 가능

Primer_design.jpg

분석 결과

  • LabKM을 이용한 고객과의 결과 데이터 공유 및 커뮤니케이션
  • 분석 보고서 제공
  • 자세한 분석 결과 및 내용 방문 브리핑 서비스


분석 의뢰






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