Ingenuity® Pathway Analysis (IPA®)는 웹 기반의 소프트웨어로 생물학적 기능과 pathway, 분자적 네트워크를 시각적으로 표현하는 도구입니다. 관심 있는 특정 질병 또는 치료 분야에서 원인 분석을 위해 Ingenuity® Pathway Analysis (IPA®)를 이용하여 쉽게 기능적 관계를 도출하고 원인이 될 수 있는 분자적 인자를 찾을 수 있습니다. 도출된 pathway에 새로운 관계를 간단한 방법으로 추가할 수 있으며 기존의 pathway와 새롭게 발견한 pathway에 새로운 정보(annotation)를 추가하여 생물학적 의미를 더할 수 있습니다. Upstream pathway를 밝혀 원인을 분석하고 Downstream에 미칠 수 있는 영향을 분석하여 나아가서 질병과 약물의 영향을 밝힐 수 있는 경로를 제공합니다.

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Features

  • 전문 큐레이션의 노력으로 구축된 데이터베이스로부터 관심 있는 치료영역과 특정질병에 대해 커스터마이즈가 가능합니다.
  • 분자에서 질병까지 또는 기능 관계와 원인분석, 네트워크 가시화가 가능합니다.
  • Genes, drug, chemicals, disease processes 등의 가장 최근의 연구결과를 반영한 정보로 분석을 할 수 있습니다.
  • 두가지 이상의 샘플에 해당되는 각각의 시그널에서 유사한 패턴을 찾거나 scoring, cluster를 할 수 있습니다.

Applications

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{i} Gene & Chem & Disease/Function View


*유전자와 약물, 질병에 대한 자세한 설명을 제공합니다 .
* gene, drugs, chemicals, protein, disease, signaling, metabolic pathway 정보를 포함합니다.
* 관심이 있는 factor의 링크를 통해 깊이 있는 연구를 진행할 수 있습니다.

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{i} Human Isoform View


* 유전자 크로모좀 locus map, 유전자의 스플라이싱된 전사체 정보, 특정 단백질의 isoforms과 그에 해당하는 길이 정보를 제공합니다.
예측되는 단백질 도메인 정보
문헌정보에 있는 expression, function, 특정 splice variant 조절 인자 정보를 제공합니다.

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{i} Canonical pathways


* 일반적으로 알려져 있는 관심 있는 유전자나 질병 패스웨이를 보여줍니다.
* 각각 패스웨이의 p-value값을 통해 신뢰성 있는 패스웨이를 선택할 수 있습니다.
* 관심 있는 패스웨이를 선택적으로 가시화할 수 있습니다.

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{i} Upstream Regulator


* 관심 있는 패스웨이에서 상위 조절자를 검색할 수 있습니다.
* 상위 조절자에 의해 조절되는 유전자의 발현 양상을 볼 수 있습니다
* 관심 있는 상위 조절자가 관여하는 네트워크를 선택적으로 가시화할 수 있습니다.

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{i} Downstream Effects Analysis


* 하위 시그널에서 일어나는 변화를 Heatmap으로 보여줍니다.
* 하위 시그널에서 발현하는 유전자가 function에 따라 분류되며, 발현 양상이 어떻게 달라지는지 예측할 수 있습니다.

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{i} Regulator Effects Analysis


* Regulator에 의해 조절되는 상위 경로와 하위 경로를 계층적으로 가시화해 줍니다.

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{i} microRNA Tools


* mRNA을 타겟하고 있는 miRNA를 스크리닝 할 수 있습니다.

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{i} Interaction Networks


* 여러 개의 네트워크의 상호작용을 가시화합니다.
* 실험 적인 값을 패스웨이 상에 Overlay 할 수 있습니다.
* 기존 패스웨이에 관심 있는 유전자나 약물을 추가하여 커스터마이징할 수 있습니다.

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{i} Comparisons Analysis


* 2개 이상의 데이터세트를 벤다이어그램으로 공통되는 유전자나 차별성 있는 유전자 정보를 뽑을 수 있습니다.
* 각각의 데이터세트가 관여하는 패스웨이를 조건별로 비교하기 위한 Heatmap을 제공합니다.

System Requirement

  • Window
    • Windows 8, 7, XP SP2 or later
    • Internet Explorer 6 or later, Firefox 5 or later, Chrome 10 or later, Safari 5.05 or later
  • Mac
    • OS 10.9 Mavericks, OS 10.8 Mountain Lion, OS 10.7 Lion
    • Firefox 5 or later, Safari 5.0.5 or later, Chrome 10 or later (with JRE 1.6.0_xx only. Chrome is incompatible with 1.7.0_xx)
  • RAM
    • 1.25GHz, 2GB RAM(권장사항: 2GHz, 4GB RAM)
  • Resolution
    • Minimum Screen Resolution of 1024×768


관련 문의 : Marketing팀 (대표전화 : 031-278-0061, 이메일 : marketing@insilicogen.com)






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