Map Reads to Reference에서 output을 track(혹은 stand alone)으로 나왔는데 다른 포맷으로 변환하고 싶습니다. 공유 링크드인 공유 페이스북 공유 트위터 공유

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Map Reads to Reference 툴을 이용하여 reference에 맵핑을 진행할 때 결과는 아래와 같이 두 종류 중 한 가지만 택할 수 있습니다.

아래를 보시면 Output options에 Create read track과 Create stand-along read mapping 중 선택하도록 라디오 버튼으로 되어있습니다.

Stand alone 은 reference 서열과 coverage, mapping된 read의 양상까지 모두 한번에 볼 수 있는 결과 파일이며, track포맷은 동일한 reference를 가지는 다양한 track포맷의 결과를 함께 볼 수 있도록 지원하는 포맷입니다(Genome browser 같은 역할로 variant track도 함께 볼 수 있음.).

보고자 하는 목적이나 방향에 따라 output 타입을 바꾸어야 하는데, output 옵션을 잘못 선택해서 재분석 하는 일이 없도록 서로의 포맷을 변환 시켜주는 기능이 있습니다. 바로 Track Tools에 들어있는 convert 툴들 입니다.

Track형태의 결과를 stand alone으로 변경하시고자 할 때는 'Convert from Tracks'를 Stand alone형태의 결과를 track으로 변경하고자 할 때는 'Convert to Tracks'를 선택해주시기 바랍니다.

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