- 다수의 Variant 분석 결과를 필터링 하고싶습니다. 공유
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같은 reference를 기준으로 해서 여러 샘플을 맵핑한 다음 특이적인 변이, 혹은 공통적인 변이를 찾기 위한 툴이 있습니다.
바로 Filter Based on Overlap이라는 툴인데, Track Tools 하위에서 찾을 수 있습니다.
먼저 track 포맷의 파일을 input으로 넣습니다. 공통적인 변이를 찾을 때는 input 순서는 상관이 없고, 특이 변이를 찾는 경우에는 보고싶은 변이의 track을 넣으시면 됩니다.
그 뒤로 overlap 필터링에 사용될 트랙을 선택한 다음, overlap 된 부분을 남겨 놓을지 제거할지 선택해주면 됩니다.
Keep annotation with overlap은 공통적인 variant만 보여주고,Keep annotation with do not overlap은 overlap track과 중복되는 부분은 제거한 뒤 보여줍니다.
