De novo assembly long reads (beta)의 option에서 minimum coverage, word size, minimum anchor length는 정확하게 무엇을 의미하는 지 알 수 있을까요? 공유 링크드인 공유 페이스북 공유 트위터 공유

De novo assembly long reads (beta)의 option에서 minimum coverage, word size, minimum anchor length는 정확하게 무엇을 의미하는 지 알 수 있을까요? 링크드인 공유 페이스북 공유 트위터 공유

 * minimum coverage

-> Contig가 생성될 때 고려할 overlap을 위한 최소 지원의 reads 수

 

 * word size

-> 데이터베이스 빌드에 사용되며, query sequence의 중복을 찾는데도 사용되는 k-mer 크기

 

 * minimum achor length

-> Contig 형태로 연결되기 위해 2개의 reads 사이의 최소 overlap 길이

목록