Read mapping시, 각 read 색상은 다음을 의미합니다.
- 초록색 : Forward 방향 single read
- 붉은색 : Reverse 방향 single read
- 진한 파란색 : Forward 방향 paired read
- 연한 파란색 : Reverse 방향 paired read
- 노란색 : Non-specific match (mapping시, 여러 곳에서 match)
- 연한 글씨 : Unaligned end (soft-clipped read end)
- 검정색 글씨 + 연한 색깔 배경 : Mismatch (A: 빨간 배경, T: 초록 배경, C: 파랑 배경, G: 노랑 배경)
가는 선은 read 사이의 공백을 나타내고, 점은 indel을 나타냅니다.
이러한 기본 색상은 아래 그림과 같이 side panel에서 변경할 수 있습니다.
더욱 자세한 설명은 아래 온라인 매뉴얼 링크를 통해 참고해주세요.
https://resources.qiagenbioinformatics.com/manuals/clcgenomicsworkbench/current/index.php?manual=Coloring_mapped_reads.html