Mapping Data 및 Mapped Read & Unmapped Read Export 방법이 궁금합니다. 공유 링크드인 공유 페이스북 공유 트위터 공유

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1. Reference Mapping 

Map read to Reference Tool을 이용하여 Mapping을 원하는 read 및 Reference Sequence를 선택해줍니다.

 

  

Mapping Option을 모두 선택 후 Result Handling에서 “Collect unmapped reads”옵션을 선택해주시면 Mapping되지 않은 Read들이 따로 Output됩니다. (써모 데이터의 경우 Single read만 나옵니다) 

 

<<Result output>>

 

2. Reference Mapping data 내보내기

CLC 상단의 Export 버튼을 클릭하여 “BAM” File 포맷을 선택합니다.

 

 

Export 하려는 Mapping 데이터를 선택해주시고, 바탕화면 등 저장 위치를 지정해주시면 됩니다.     

3. Unmapped Read 내보내기

Export 하려는 Unmapped read를 선택해주시고, 바탕화면 등 저장 위치를 지정해주시면 됩니다.   

4. Mapped Read 내보내기

“Extract read Tool”을 이용하여 Mapping 데이터를 선택하셔서 read를 분리해줍니다.

이때 Result handling 옵션에서 “Create Sequence List(s)” 를 체크해주세요. (써모 데이터의 경우 Single read만 나옵니다)

 

진행해주시면 아래와 같이 “Extracted read”라는 Tag를 가지고 Mapping되었던 Read들이 분리되어 나옵니다.

 

CLC 상단의 Export 버튼을 클릭하여 “Fastq 또는 Fasta” File 포맷을 선택합니다.

 

Export 하려는 Extracted read를 선택해주시고, 바탕화면 등 저장 위치를 지정해주시면 됩니다.  

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