자주 묻는 질문 | (주)인실리코젠-생물정보 전문기업

IPA에서 특정 조직계의 전달 물질에 관련된 분석이 가능한가요? 조회 1221 2021. 04. 23 - IPA에서 특정 전달물질에 대한 분석을 지원하지는 않습니다. 하지만 Tissue & Cell Lines 에서 신경 관련으로 한정시키고 분석을 진행한다면 한정된 결과만 얻으실 수 있어 연구에 도움이 될 수 있습니다. 신경계를 예로 들어 아래 그림을 보신다면 이해가 빠를 것 같습니다.
IPA에서 metabolomic analysis도 제공하는 것 같은데, 혹시 이 경우에는 대사체의 어떤 것을 넣어서 진행하면 될까요? 조회 1269 2021. 04. 23 - >> Input으로 CAS Registry Number, PubChem CID, HMDB와 KEGG identifiers 를 지원합니다. >> Core Analysis 진행 시, Metabolomics Analysis를 선택하시고 분석을 진행하시면 됩니다.
PDR score 란 무엇인가요? 조회 1066 2021. 04. 23 - Phenotype Driven Ranking(PDR)으로 hereditary workflow 에서만 적용 가능하며 PDR score로 변이 리스트를 내림차순으로 정리할 수 있습니다 (Krämer, Andreas, et al. "Leveraging network analytics to infer patient syndrome and identify causal genes in rare disease cases." BMC genomics 18.5 (2017): 15-23). PDR algorithm은 QIAGEN knowledge base(KB) DB를 활용하여 사용자가 제공한 phenotype 정보와 질병 관련 유전자와의 유사성 정도를 점수화 합니다. PDR algorithm은 사용자가 환자의 phenotype 및 symptom 정보를 입력 시에만 사용 가능합니다.
특정 균주를 제외하고 PCoA 분석을 할 수 있나요? 조회 1191 2021. 04. 23 - 샘플 군집에서 특정 균주를 제외한 후 PCoA 분석 가능하며, abundance table에서 특정 균주만 제외시킨 후 따로 저장한다음, PCoA 분석을 진행하시면 됩니다.
Beta diversity 분석법 중 Bray-Curtis 방법은 어떤 방식인가요? 조회 3863 2021. 04. 22 - Bray-Curtis 분석 방법 경우에는 taxa 종류와 그 taxa 비율이 얼만큼 인지를 비교하는 방식입니다. 즉, 어떠한 균을 공유하고 있는지 (Qualitative)와 공유하고 있는 그 균의 풍부도 (Quantitative)는 얼만큼 차이나는지를 같이 보는 방식입니다.

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