• [릴리즈] BIOBAM Blast2GO : Major Release Version 5.2 조회 1814 2018. 08. 16 - Blast2GO 5.2가 출시되었습니다. 이번 업데이트를 통해 Blast2GO를 통해 직관적인 기능유전체 분석이 가능해졌습니다. Multiple trimming기능으로 FastQ Pre-Processing (Adapters, Quality, Length) 여러개의 리스트를 비교하여 사용자 맞춤형의 Venn Diagram을 그릴 수 있습니다. 다른 추가된 기능을 보시려면 여기를 클릭하세요.   Blast2GO 업데이트는 자동으로 수행됩니다. Blast2햬 4버전 이하를 사용하시는 분들은 5버전으로 꼭 업그레이드를 해주세요!
  • [릴리즈] New 2018.2 databases release and geneXplain's news for your info 조회 2036 2018. 05. 04 - 2018.2 버전의 데이터베이스 사용이 가능합니다! TRANSFAC®, HumanPSD™ 및 TRANSPATH® 데이터베이스가 2018.2 버전으로 업데이트 되었습니다.TRANSFAC® 2018.2 버전의 새로운 기능 : TRANSFAC® PWM과 파생 매트릭스 권장 사항의 성능 평가 ENCODE의 새로운 Human ChIP-Seq 실험 결과 추가  ENCODE의 새로운 Human ChIP-Seq 실험 결과 추가 Ensembl 91버전으로 업데이트된 데이터를 기존의 Ensembl 데이터에 통합 자세한 내용은 아래의 링크를 참조하세요.>> TRANSFAC® 업데이트 더 알아보기>> TRANSFAC® statistics TRANSPATH® 2018.2 버전의 새로운 기능 : Human phosphatases interactome 추가BioPlex의 정보 통합HumanPSD™ 2018.2 버전의 새로운 기능 : 약물과 임상 시험의 맵핑에 대한 조정 건들의 증가 암 바이오마커 추가자세한 내용은 아래의 링크를 참조하세요.>> TRANSFAC® 업데이트 더 알아보기>> TRANSFAC® statistics2018.2 버전의 release는 geneXplain 플랫폼과 통합되어 있어 미리 세팅되어진 다른 워크플로우나 upstream 분석을 수행하는 geneXplain 사용자들도 이용이 가능합니다. geneXplain 4.9버전을 확인해보세요.TRANSFAC과 MATCH를 이용한 article 안내Nature Communications에 게재 된 최근 기사에서 TRANSFAC 데이터베이스와 MATCH 도구를 사용하여 전사 인자 결합 사이트 (DNA 결합 단백질)로 추정되는 영역을 확인했습니다. 이 논문의 저자들은 혈청 반응 인자 (Srf)가 세포 유형 특이적인 유전자를 억압하고 세포의 유도다능성에 대한 재프로그래밍을 촉진할 수 있음을 보여 주었습니다. "Srf destabilizes cellular identity by suppressing cell-type-specific gene expression programs"라는 article은 여기를 클릭하여 확인하실 수 있습니다.  geneXplain을 체험해보시고 싶으신 분은 marketing@insilicogen.com 으로 요청주시면테스트를 위한 계정을 준비해드리도록 하겠습니다.
  • [릴리즈] BIOBAM Blast2GO : Major Release Version 5.0 조회 2243 2018. 02. 09 - PAG Plant & Animal Genome Conference에 맞추어 Blast2GO 5를 출시했습니다! 이 새 버전에서는 새로운 기능들이 추가 되었습니다.무엇보다 가장 중요한 것은, 다양한 분석 단계에서 빠른 속도로 분석 할 수 있도록 도와주는 Blast2GO가 BioBam Cloud나 AWS 아키텍쳐가 Blast2GO와 연동된다는 점 입니다. 자세한 정보는 아래를 참조하시기 바랍니다.버전 4에서 5로 업그레이드하려면, 여기에서 최신 버전을 다운로드해야합니다.마이너 업데이트들은 자동으로 수행됩니다.피드백이나 문의사항이 있으시면 consulting@insilicogen.com로 연락 주시기 바랍니다.버전 5의 주요 기능 업그레이드 내용 :InterProScan을 cloud로 분석 (CloudIPS)Workflow (생성, 보기, 실행)De-Novo Transcript 발현 값 분석 (Fasta + FastQ)Blast Result Alignment 뷰어고성능 GFF 파일 뷰어"RNA-Seq" 및 "Gene Finding" 결과의 PDF 레포트새로운 Gene Ontology ID-매핑 전략 (더 빠르고 더 완벽하게, 독립적인 "gi")많은 결과를 보여주기 위한 새로운 디자인"Find Similar Sequences” 성능 향상Species taxonomy 분석 속도 개선Preferences : 메모리 및 임시 파일 설정 정의Preferences : Gene Ontology 버전 선택 : 최신버전 혹은 월별로 선택 가능"클라우드 사용" 모니터링의 개선
  • [릴리즈] geneXplain platform과 TRANSFAC(R), HumanPSD™,TRANSPATH(R) 데이터베이스 조회 1628 2018. 01. 23 - 새로운 기능이 추가되었습니다! 새해를 맞이하여 geneXplain 플랫폼과 TRANSFAC® 및 HumanPSD ™ + TRANSPATH® (PROTEOME ™) 데이터베이스가 업데이트 되었습니다. 계정에 로그인하여 최신 기능을 이용해 보세요.geneXplain 플랫폼 릴리즈 4.8geneXplain 플랫폼은 광범위한 생물정보학, 시스템 생물학에 적용하기 쉬운 온라인 툴박스로 워크플로우 관리 시스템입니다. geneXplain 플랫폼에 새롭게 추가된 기능들은 다음과 같습니다.   - 새로운 사이트 분석 및 통계 방법  - 사이트 검색 및 HTML 리포트 기능   - 개선된 사용자 인터페이스 뷰   - 업데이트 된 TRANSFAC®와 TRANSPATH® 및 HumanPSD ™ 데이터베이스의 통합 새롭게 업데이트된 geneXplain 플랫폼 4.8의 자세한 설명은 다음 링크를 통해 볼 수 있습니다. >> geneXplain 플랫폼 릴리즈 4.8 TRANSFAC® 릴리즈 (2018년 1월)TRANSFAC®은 전사인자, 그리고 유전적 Binding Site와 DNA 결합 모티프(PWMs)에 대한 데이터베이스입니다.TRANSFAC® 데이터베이스의 새 버전에는 다음 기능들이 업데이트되었습니다.   - 38개 포유류 종에 대한 전사 인자 범위 증가  - 마우스와 ENCODE로부터의 휴먼 ChIP-Seq 실험 정보를 통합    - JASPAR 2018 매트릭스 라이브러리 통합  - Ensembl release 90 까지 업데이트 완료 업데이트된 TRANSFAC® 데이터베이스를 더 자세히 보기 위해 아래 링크를 클릭하세요. >> TRANSFAC® 자세히 보기 HumanPSD ™ + TRANSPATH® 릴리즈 (2018년 1월)Human Proteome Survey 데이터베이스 (HumanPSD ™)는 질병관련 바이오마커와 약물 타겟인 휴먼 단백질을 중점적으로 다룹니다. HumanPSD ™ 데이터베이스의 새 버전에는 다음 기능이 추가되었습니다.     - 질병 보고서를 기반으로 바이오마커 검색   - 질병 관련 임상 시험 조건의 다양성 증가 포유류 신호 전환 및 물질 대사 경로의 TRANSPATH® 데이터베이스에는 다음과 같은 새로운 기능이 추가되었습니다.   - 다양한 유형의 암 발생에 관여하는 패스웨이는 이제 signal transduction pathways의 개요 페이지에 자세히 나와있습니다. 업데이트 된 TRANSPATH® 및 HumanPSD ™ 데이터베이스 릴리즈 (2018년 1월)에 대한 자세한 설명은 아래 링크를 통해 보실 수 있습니다.>> TRANSPATH® 및 HumanPSD ™ 자세히 보기 출시 예정효소, 또는 효소 리간드에 대한 정보를 담고 있는 BRENDA 데이터베이스가 곧 출시 될 예정이니 많은 관심을 바랍니다. 비디오 튜토리얼geneXplain platform 인트로 비디오>> 비디오 보기TRANSFAC 데이터베이스 인트로 비디오>> 비디오 보기MATCH 알고리즘 인트로 비디오>> 비디오 보기
  • [뉴스레터] LabCollector version 5.3 출시 (업그레이드 안내) 조회 1319 2017. 11. 03 - LabCollector의 많은 중요한 기능이 업데이트 되었습니다.Import / Export 기능 : * 새 기능 :  - Import Data 기능이 더 쉽게 진행될 수 있도록 재디자인(더 알아보기)  - Equipment 모듈 : maintenance export 가능(일반/장비) 및 Maintenance로 필터 가능  - 화학구조의 SDF 파일 포맷 export와 fasta, plasmid와 sequence들의 gb파일 export 가능 * 기능 향상 :  - 쉬운 인터페이스와 함께 저장 importer * 추가 :   - 저장 브라우저에서 격자 형태의 저장 데이터 export 가능  - '시간'과 '유저리스트' 타입의 새로운 커스텀 필드  - 접미에 커스텀필드 추가하여 value값 뒤에 text가 항상 보일 수 있도록 함.  - 이메일 알람 기능에서 통계적인 값에 옵션을 추가하기 위해 10진수의 커스텀 field 추가접근 가능 기능 :  * 새 기능 :  - 그룹 정책이 adds on에서도 특정 그룹이 block 되도록 설정 가능 * 변경 :  - master 관리자가 새로운 lab members를 추가 할 수 있도록 함(user 계정 뿐 아니라) * 추가 :   - 보안 그룹을 프로젝트 코드와 연결  - IP로부터 로그인 규율을 제한 Reagents & Supplies (시약&공급) : * 추가 :  - 모듈에 이제 위험 탭에 대한 사용자 정의 필드가 있습니다.  - 시약 및 소모품 모듈의 위험 탭 필드를 시약 및 소모품 내보내기 / 인쇄 가능  - Reagents & Supplies 모듈의 Risks 탭 필드를 이제 필터로 사용 가능  - Chemical lots : 이제 파일 / 보고서를 업로드하고 특정 로트와 연관 가능  - Chemical lots를 파괴 할 수있는 옵션 (데스트락 허가를 받은 사용자만 로트를 파괴 가능)기타 : * 기능 향상 :   - 플라스미드 맵 에디터  - 프린트 할 때 자바 필요 없음 * 새 기능 :   - 많은 아이콘과 커스텀 모듈 관리의 추가 옵션  - 새로운 웹서비스 API  - 워크플로우 Add-on이 활성 워크플로우에 탭 추가
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