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2018.03.09 12:18111 다수의 Variant 분석 결과를 필터링 하고싶습니다. 공유
2018.03.09 12:18 다수의 Variant 분석 결과를 필터링 하고싶습니다.

같은 reference를 기준으로 해서 여러 샘플을 맵핑한 다음 특이적인 변이, 혹은 공통적인 변이를 찾기 위한 툴이 있습니다.

바로 Filter Based on Overlap이라는 툴인데, Track Tools 하위에서 찾을 수 있습니다.

먼저 track 포맷의 파일을 input으로 넣습니다. 공통적인 변이를 찾을 때는 input 순서는 상관이 없고, 특이 변이를 찾는 경우에는 보고싶은 변이의 track을 넣으시면 됩니다.

그 뒤로 overlap 필터링에 사용될 트랙을 선택한 다음, overlap 된 부분을 남겨 놓을지 제거할지 선택해주면 됩니다.
Keep annotation with overlap은 공통적인 variant만 보여주고,

Keep annotation with do not overlap은 overlap track과 중복되는 부분은 제거한 뒤 보여줍니다.



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