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2019.01.23 16:52111 IPA에서 FoldChange와 RPKM을 동시에 업로드 후 각각 분석이 가능한가요? 공유
2019.01.23 16:52 IPA에서 FoldChange와 RPKM을 동시에 업로드 후 각각 분석이 가능한가요?

Q : IPA에 업로드하는 data set에 fold change뿐만 아니라 RPKM 값도 올릴 수 있는 걸로 알고 있는데, 그러면 처음 업로드하는 file에 fold change와 RPKM을 모두 올린 후 각각을 나눠서 분석이 가능한지 문의드립니다.

 

A : 업로드 데이터 셋에서 fold change 뿐만아니라 RPKM 값도 함께 올리실 수 있습니다.

엑셀파일을 올려주신 후 첨부해주신 컬럼에서 무슨 데이터인지를 선택할 때, Observation 1 -> Fold change | Expression intensity/RPKM으로 각각 선택해주시면 됩니다(샘플별로). 하지만 core analysis 분석을 할 때는 두 가지 값 중에 어떤 데이터로 기준을 할지에 대해 선택하게 되어서 두 가지 값을 모두 고려하지는 않습니다.

즉 필요하신 경우 input 데이터에는 2가지 값을 모두 넣어서 업로드하시고, core analysis 돌리실 때 기준을 선택하여 각각 돌려보실 수 있습니다.

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