FAQ
게시판 리스트
-
Taxonomic Profiling을 진행했는데, taxonomic 분석에서 나온 균주의 sequence를 얻을 수 있는 방법을 알 수 있을까요? 조회 1043 "Taxonomic Profiling" tool Output options에서 'Reads matching the reference database' 옵션을 선택하고 돌리시면 원하시는 결과를 얻으실 수 있습니다.
-
Reference에 mapping한 뒤, Variant Detection을 수행하여 나온 파일에서 gene정보가 안보여요. 조회 1131 결과 테이블 Overlapping annotation 컬럼에서 gene 정보를 확인하실 수 있습니다.
-
OmicSoft에서 SRA를 바로 다운로드 하고 싶습니다. 조회 1229 상단의 Tools > Data > Download SRA Data (NGS)를 클릭하세요. 먼저 위의 Output folder에서 저장할 경로를 선택해주시고, 아래에 SRA ID를 적어주세요. 구분자는 엔터로 1줄에 하나의 SRA ID를 적으시면 됩니다.
-
OmicSoft에서 R의 일부 패키지를 사용 가능한 것으로 알고 있는데, 최소 버전이 궁금합니다. 조회 1137 OmicSoft 분석 시, R의 몇몇 패키지를 사용하여 분석을 진행하실 수 있습니다. 특히 Single Cell 분석에 관련한 tool도 일부 탑재되어 있습니다. 아래는 해당 tool과 버전입니다. 4버전에 대한 부분은 아직 언급된 바 없으며, 3.5.3 버전까지는 현재 사용가능합니다. 3.6.0 이상 버전에 대해서도 공식적으로 언급된 바는 없습니다. 패키지의 업데이트로 인해 명령어가 바뀌는 경우 진행이 어려울 수 있으며, 기존에 설치된 R에서 해당 패키지와 연관성을 가지는 패키지까지 먼저 설치하신 후 OmicSoft에서 적용하시는 것을 추천드립니다.
-
QCII에서 나온 변이 리스트 Export 방법 조회 1219 Variant list page 맨 우측 중간에 클라우드 모양의 다운로드 아이콘을 클릭하시면 원하시는 annotation column 을 커스터마이징 하여 다운로드 받으실 수 있습니다. *.tsv, *.csv, *.vcf, 및 IPA 포맷으로 다운로드 받으실 수 있습니다.
전체 317개 중 5개 표시