FAQ
게시판 리스트
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Q. ireport H의 데이터 보안은 어떤 형태로 이루어지나요? 조회 389 ireport H는 샘플이 아닌 변이 정보를 국내(서울)의 QIAGEN Knowledge Base QCII 데이터센터를 통해 임상 해석 정보를 제공받아 분석을 수행하고 보고서 작성 단계에서 개인 정보를 입력할 수 있지만(선택적), 플랫폼 자체에서 개인 정보를 데이터베이스에 저장하지 않기 때문에 유출될 위험이 없습니다.
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Q. ireport H의 데이터베이스 최신화는 어떻게 수행되나요? 조회 212 서울에 호스팅 된 QIAGEN Knowledge Base QCII 데이터센터를 자체적으로 운영하기 때문에 주기적인 업데이트가 즉각 반영됩니다.
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Q. ireport H의 임상적 변이 해석의 콘텐츠는 신뢰할 수 있나요? 조회 220 ireport H는 QIAGEN Knowledge Base를 이용하는 QCII(QIAGEN Clinical Insight Interpret)를 활용하여 개발되었습니다. QIAGEN Knowledge Base는 20년 동안 과학 저널, molecular content databases 및 textbooks 등을 종합하였으며, 전문가들의 리뷰 과정을 통해 매달 4,000건 이상의 큐레이션이 진행되고, 최종적으로 매일 3,000개 이상의 콘텐츠가 DB에 업데이트됩니다. 또한, Public Database인 TCGA, ClinVar, dbSNP, 1,000 Genomes, gnomAD 등을 포함하고, QIAGEN 자체 큐레이션 DB인 HGMD, PGMD, Clinical 자료 및 CADD, PolyPhen, SIFT 등 존재하는 모든 변이 정보를 담아냈다고 할 수 있을 만큼 방대한 DB입니다. QCII는 의료 기기 및 품질 관리 시스템에 대해 ISO 13485:2016 인증을 받은 솔루션이며, 2024년 5월에는 유럽의 In Vitro Diagnostic Medical Device Regulation (EU) 2017/746 (IVDR)의 인증을 받았습니다.
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Mapping Data 및 Mapped Read & Unmapped Read Export 방법이 궁금합니다. 조회 598 1. Reference Mapping Map read to Reference Tool을 이용하여 Mapping을 원하는 read 및 Reference Sequence를 선택해줍니다. Mapping Option을 모두 선택 후 Result Handling에서 “Collect unmapped reads”옵션을 선택해주시면 Mapping되지 않은 Read들이 따로 Output됩니다. (써모 데이터의 경우 Single read만 나옵니다) <<Result output>> 2. Reference Mapping data 내보내기CLC 상단의 Export 버튼을 클릭하여 “BAM” File 포맷을 선택합니다. Export 하려는 Mapping 데이터를 선택해주시고, 바탕화면 등 저장 위치를 지정해주시면 됩니다. 3. Unmapped Read 내보내기Export 하려는 Unmapped read를 선택해주시고, 바탕화면 등 저장 위치를 지정해주시면 됩니다. 4. Mapped Read 내보내기“Extract read Tool”을 이용하여 Mapping 데이터를 선택하셔서 read를 분리해줍니다.이때 Result handling 옵션에서 “Create Sequence List(s)” 를 체크해주세요. (써모 데이터의 경우 Single read만 나옵니다) 진행해주시면 아래와 같이 “Extracted read”라는 Tag를 가지고 Mapping되었던 Read들이 분리되어 나옵니다. CLC 상단의 Export 버튼을 클릭하여 “Fastq 또는 Fasta” File 포맷을 선택합니다. Export 하려는 Extracted read를 선택해주시고, 바탕화면 등 저장 위치를 지정해주시면 됩니다.
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개인 컴퓨터에서 CLC Network license의 적용 방법을 알고 싶습니다. 조회 646 먼저 CLC Genomics Workbench를 사용하려는 컴퓨터 제어판 – 시스템 및 보안 – Windows Defender방화벽 – 고급설정에 접속해주세요.인바운드 규칙을 클릭하여 접속 후, 새 규칙을 클릭해 주세요.포트를 선택해주세요.TCP/UDP를 선택합니다. 포트를 6200으로 설정해주세요. 이후 아래 이미지와 같이 세팅해주세요. 이름을 설정합니다.완료 후 포트가 생성되며 이 과정을 인바운드 규칙/아웃바운드 규칙에 모두 수행해주시고, 이때 UDP/TCP도 각각으로 만들어주세요. • 인바운드 규칙 : UDP/TCP 아웃바운드 규칙 : UDP/TCP 총 4번을 수행해야합니다. CLC Genomics Workbench의 접속하여 Help – License Manger로 접속합니다. Configure License Server Connection을 선택해 주세요.Hostname/IP-address: IP주소 입력 (고정IP주소를 사용하는 것이 좋으므로 IT 관련 담당자에게 문의 후 사용해주세요)Port: CLC Network License Manager 또는 CLC License Server가 사용하는 포트를 입력해주세요. (기본값 : 6200) 해당되는 License를 선택하면 License Key를 사용할 수 있습니다. (1대의 컴퓨터에서 사용 시 종료해야 다른 컴퓨터에서 사용 가능합니다)
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