FAQ
게시판 리스트
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HGMD에서 관련 변이에 대한 reference 정보의 출처도 확인할 수 있나요? 조회 1129 네. 가능합니다 HGMD 결과에서 HGMD accession number 를 이용해서 확인하실 수 있습니다. HGMD accession 정보를 클릭하시면 관련 페이지에 Comments/notes 섹션에서 자세히 어느 부분에 관련 변이가 언급되었는지 확인하실 수 있습니다.
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miRNA 분석 시 Annotation 파일 관련해서 RNA central mirbase를 어디서 받을 수 있는지 궁금합니다. 조회 1126 RNAcentral은 별도의 DB이므로 직접 다운로드 받아서 import 해주셔야 합니다. http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/RNAcentral/releases/16.0/id_mapping/database_mappings/mirbase.tsv 위 링크로 받으시면 됩니다. (버전은 업데이트될 수 있으니, 항시 체크해서 받아주세요.)
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Assembly 이후 각 서열의 peak를 확인하고 싶습니다. 조회 1134 CLC Workbench에서 assembly 파일을 여신 후, 오른쪽 side panel에서 아래 이미지처럼 설정을 변경해보세요.
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Search for Sequences at NCBI에서 다음과 같은 에러가 났을 때의 해결 방안을 알려주세요. 조회 1380 상단과 같은 에러가 발생하는 원인은 현재 사용하시고 계시는 곳에서 프록시 서버를 통해 인터넷에 접속하는 방식이기 때문입니다. 따라서 해당 망의 프록시 서버 정보를 기관의 전산팀에 문의하신 후 CLC Main Workbench에 기입하여야 합니다. 기입 방법 1. 현재 실행하고 계신 CLC Main Workbench를 종료하신 후 관리자 권한으로 실행해주세요. 2. 상단의 Edit > Preferences를 클릭해주세요. 3. 아래 그림의 네모칸에 Host 정보와 포트정보를 기입하시고 Ok를 누르신 후, CLC Main Workbench를 재시작해주세요. 4. 사용하시고자 하는 tool이 정상적으로 작동하는지 확인해주세요.
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HGMD online 의 검색옵션은 어떻게 되나요? 조회 1048 5가지 방식의 검색 옵션을 활용하실 수 있습니다 1. Gene symbol search - official HUGO Gene Nomenclature Committee gene symbol 기반으로 검색합니다. 2. Gene description search - Nomenclature Committee 기반으로 gene 검색을 합니다. 3. OMIM number search - OMIM number로 검색하실 수 있습니다. 4. GDB number search - GDB number로 검색하실 수 있습니다. 5. Disease/phenotype search -HGMD에 보고된 변이와 관련된 질병을 검색할 수 있습니다
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