FAQ
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CLC Genomics Workbench 설치가 잘 되지 않습니다. 조회 1172 1. cmd를 관리자 권한으로 실행하세요. 2. "cd" 명령어를 사용하여 CLC Genomics Workbench 또는 CLC Main Workbench 설치 프로그램 파일이 있는 위치로 이동하세요. 3. 다음 명령어로 설치 프로그램을 실행하세요. CLCGenomicsWorkbench_21_0_3_64.exe -J-XX:UseAVX=0 (21_0_3은 버전 정보) 위 방법으로도 안될 시, 다음과 같이 진행하세요. 1. C:\temp 폴더를 만드세요. 2. command line에서 다음 명령어를 실행하세요. CLCGenomicsWorkbench_21_0_3_64.exe -temp C:\temp 문제가 계속되면 Java 소프트웨어 설치 로그 파일과 함께 command line의 오류 메시지 스크린 샷을 consulting@insilicogen.com 으로 보내주세요. Java 설치 로그 파일 찾는 법은 아래 링크를 참조하세요. https://www.java.com/en/download/help/log_files.xml 보내주실 때, 다음 파일들을 보내주세요. jreMSI.log java_install.log java_install_reg.log jusched.log JavaDeployReg.log 이름에 "i4j"가 있는 기타 .log 파일
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Abundance table안의 샘플들끼리 어떤 차이가 어떻게 있는지를 확인하고 싶은데, 가능한가요? 조회 822 네, CLC Premium Module을 구매하셨다면 가능합니다. "Microbial Genomics Module | Metagenomics | Abundance Analysis | Differential Abundance Analysis" tool을 이용하여 그룹간 비교 가능합니다. 비교를 어떤 방식으로 하실지 (Across groups, All group pairs, Against control group)는 연구자 재량에 맞게 선택하시면 됩니다.
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OTU table에 metadata를 입혀 그룹별로 데이터를 확인하고 싶습니다. metadata를 어떻게 입히나요? 조회 1219 "Microbial Genomics Module | Metagenomics | Abundance Analysis | Add Metadata to Abundance Table" tool을 이용하여 metadata를 입힐 수 있습니다. 인풋은 OTU table이며, metadata는 엑셀 포맷으로 작성하시되, 첫 번째 column은 샘플 이름, 그 다음 column부터는 데이터 성격에 따라 채워주시면 됩니다. (Workbench내에 있는 샘플 이름과 metadata 샘플 이름은 동일해야 합니다.)
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Microbial Genomics Module tool 중 Amplicon-based database를 구축할 수 있는 tool이 없어졌어요. 조회 1056 CLC Microbial Genomics Module이 21버전으로 업그레이드 되면서 해당 tool은 "Microbial Genomics Module | Tools | Create Annotated Sequence List" tool로 합쳐졌습니다.
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항생제 내성, 독성 관련 유전자를 선별하는 분석을 할 수 있나요? 조회 1050 "Microbial Genomics Module | Databases | Drug Resistance Analysis | Download Resistance Database" tool에서 데이터베이스를 다운로드 받으신 후, "Microbial Genomics Module | Drug Resistance Analysis" 하위 tool들을 이용하여 분석을 진행하시면 됩니다.
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